More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1177 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1177  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
435 aa  867    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.624502 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0332  FAD dependent oxidoreductase  60.58 
 
 
445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1799  FAD dependent oxidoreductase  45.73 
 
 
432 aa  354  2e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000252779  normal  0.373628 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2844  FAD dependent oxidoreductase  41.56 
 
 
533 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3299  FAD dependent oxidoreductase  42.63 
 
 
559 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1127  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 
384 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46832  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.05 
 
 
547 aa  277  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207234  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0397  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.93 
 
 
560 aa  276  6e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02167  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), large subunit, FAD/NAD(P)-binding  41.76 
 
 
542 aa  276  7e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1418  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  41.76 
 
 
542 aa  276  7e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.556923  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2623  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.76 
 
 
542 aa  276  7e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3378  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.76 
 
 
542 aa  276  7e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2382  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.76 
 
 
542 aa  276  7e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02126  hypothetical protein  41.76 
 
 
542 aa  276  7e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2539  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.76 
 
 
542 aa  276  7e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1410  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.76 
 
 
542 aa  276  8e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1021  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.74 
 
 
552 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2469  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.21 
 
 
542 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.357992 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2524  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.21 
 
 
542 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.21 
 
 
542 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2420  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.21 
 
 
542 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2628  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.21 
 
 
542 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710716  normal  0.455755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3991  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.48 
 
 
551 aa  273  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.172557  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2393  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.48 
 
 
542 aa  272  9e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.11 
 
 
547 aa  272  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0341607 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3957  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.33 
 
 
556 aa  272  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0227  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.93 
 
 
551 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2805  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.93 
 
 
542 aa  268  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.701913 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4111  FAD dependent oxidoreductase  40.5 
 
 
556 aa  266  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0402229 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4148  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.53 
 
 
556 aa  266  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00376439  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0933  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  39.54 
 
 
556 aa  265  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0218972  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0248  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.93 
 
 
552 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0402203  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2962  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  38.78 
 
 
556 aa  263  6e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0686  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.38 
 
 
547 aa  262  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0071  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  39.63 
 
 
556 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  39.78 
 
 
512 aa  259  9e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.150536 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1521  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  39.09 
 
 
535 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0946096  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2572  FAD dependent oxidoreductase  41.25 
 
 
407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.22049 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2516  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  37.02 
 
 
572 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.191896 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2622  FAD dependent oxidoreductase  36.91 
 
 
514 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0001851  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.56 
 
 
562 aa  248  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000682192  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1471  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  37.22 
 
 
585 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0880  FAD dependent oxidoreductase  41.4 
 
 
486 aa  241  1e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1123  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  37.8 
 
 
582 aa  241  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1228  FAD dependent oxidoreductase  37.37 
 
 
516 aa  240  4e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.677137  normal  0.683893 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1126  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 
392 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3499  FAD dependent oxidoreductase  39.1 
 
 
522 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1438  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 
539 aa  230  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.198287  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0583  FAD dependent oxidoreductase  36.18 
 
 
389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.6721  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3076  FAD dependent oxidoreductase  39.09 
 
 
408 aa  215  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5204  FAD dependent oxidoreductase  36.9 
 
 
424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 
543 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1336  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 
545 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 
556 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1419  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 
545 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 
547 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1317  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 
545 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 
545 aa  124  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2532  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 
545 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.941625  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
559 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 
539 aa  121  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 
550 aa  120  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
543 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 
576 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
566 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 
516 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 
562 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.45 
 
 
530 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  27.49 
 
 
559 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 
583 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 
546 aa  112  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
559 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  28.12 
 
 
543 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 
574 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3077  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
582 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.725388  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
575 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.21 
 
 
557 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.28 
 
 
605 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.64 
 
 
525 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 
573 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
525 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3608  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 
562 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 
533 aa  106  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 
528 aa  106  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.46 
 
 
567 aa  106  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
584 aa  106  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 
560 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 
542 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 
582 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 
578 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0499  glycerol-3-phosphate oxidase  30.26 
 
 
525 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717318  normal  0.0321239 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 
548 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 
574 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5159  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.94 
 
 
582 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 
583 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
519 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  25.59 
 
 
489 aa  100  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
552 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.39 
 
 
516 aa  100  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
529 aa  100  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>