More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1089 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3849  chaperonin GroEL  60.75 
 
 
548 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0386  chaperonin GroEL  59.81 
 
 
544 aa  640    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0411403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  60.61 
 
 
544 aa  657    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1361  chaperonin GroEL  62.66 
 
 
546 aa  654    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396838  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0520  chaperonin GroEL  62.19 
 
 
545 aa  639    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.156015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1175  chaperonin GroEL  60.15 
 
 
544 aa  657    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.462381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  62.69 
 
 
545 aa  667    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  60.33 
 
 
542 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0642  chaperonin GroEL  63.16 
 
 
547 aa  666    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1356  chaperonin GroEL  61.12 
 
 
545 aa  650    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.649732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  60.29 
 
 
540 aa  642    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0704  chaperonin GroEL  63.12 
 
 
545 aa  653    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4376  chaperonin, 60 kDa  60.38 
 
 
547 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  65.05 
 
 
544 aa  675    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  65.23 
 
 
544 aa  676    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  65.23 
 
 
544 aa  676    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2001  chaperonin GroEL  62.62 
 
 
550 aa  648    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4072  chaperonin GroEL  60.57 
 
 
547 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0436792  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0553  chaperonin GroEL  61.29 
 
 
546 aa  649    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  62.75 
 
 
541 aa  649    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2656  chaperonin GroEL  63.35 
 
 
547 aa  666    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0091  chaperonin GroEL (Hsp60, Cpn10)  62.59 
 
 
547 aa  641    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000116999  normal  0.52877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  61.58 
 
 
542 aa  667    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2192  chaperonin GroEL  62.43 
 
 
545 aa  654    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3175  chaperonin GroEL  62.62 
 
 
546 aa  648    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.509223  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  61.13 
 
 
554 aa  658    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4501  chaperonin GroEL  62.08 
 
 
548 aa  651    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.356522  hitchhiker  0.00205266 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  60.56 
 
 
547 aa  645    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3955  chaperonin GroEL  62.05 
 
 
546 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037978  normal  0.116505 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0542  chaperonin GroEL  60.23 
 
 
547 aa  642    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000020634  normal  0.698451 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0506  chaperonin GroEL  60.26 
 
 
544 aa  640    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.982033  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1306  chaperonin GroEL  61.17 
 
 
547 aa  639    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000255221  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2169  chaperonin GroEL  60.26 
 
 
544 aa  641    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.824864  normal  0.120928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  61.06 
 
 
546 aa  661    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  61.87 
 
 
548 aa  668    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  65.05 
 
 
544 aa  675    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1529  chaperonin GroEL  60.4 
 
 
545 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0685  chaperonin GroEL  61.45 
 
 
555 aa  643    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2344  chaperonin GroEL  62.83 
 
 
552 aa  662    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.00000584882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  60.29 
 
 
543 aa  640    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  65.26 
 
 
539 aa  704    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  65.03 
 
 
536 aa  674    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1938  chaperonin GroEL  61.82 
 
 
546 aa  647    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1458  chaperonin GroEL  62.81 
 
 
546 aa  648    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2394  chaperonin GroEL  62.69 
 
 
548 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0117412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  63.74 
 
 
547 aa  681    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  64.29 
 
 
540 aa  666    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1836  chaperonin GroEL  63.11 
 
 
550 aa  659    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253263  normal  0.0261483 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1131  chaperonin GroEL  61.32 
 
 
552 aa  647    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000256117  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0884  chaperonin, 60 kDa  60.56 
 
 
547 aa  640    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000145695  hitchhiker  0.0000472619 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4726  chaperonin GroEL  61.8 
 
 
551 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  65.32 
 
 
544 aa  686    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0759  chaperonin GroEL  62.69 
 
 
550 aa  652    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000585799  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2609  chaperonin GroEL  62.43 
 
 
540 aa  661    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000319213  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4544  chaperonin GroEL  62.43 
 
 
540 aa  661    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305433  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1569  chaperonin GroEL  60.91 
 
 
546 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0135  chaperonin GroEL  61.09 
 
 
546 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129883  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0422  chaperonin GroEL  62.34 
 
 
545 aa  647    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00454013  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  64.04 
 
 
550 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2160  chaperonin GroEL  61.54 
 
 
547 aa  663    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2594  chaperonin GroEL  62.05 
 
 
546 aa  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0541  chaperonin GroEL  61.48 
 
 
549 aa  650    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0616  chaperonin GroEL  63.72 
 
 
547 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0352411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  61.47 
 
 
553 aa  665    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  75.82 
 
 
545 aa  820    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  60.75 
 
 
547 aa  642    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  61.03 
 
 
539 aa  657    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0378  chaperonin GroEL  62.43 
 
 
546 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165789  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1580  chaperonin GroEL  60.48 
 
 
540 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  63.19 
 
 
541 aa  654    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  63.79 
 
 
540 aa  666    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3753  chaperonin GroEL  63.86 
 
 
548 aa  664    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  62.24 
 
 
544 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  60.85 
 
 
542 aa  658    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  62.34 
 
 
542 aa  657    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  60.44 
 
 
539 aa  645    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  60.44 
 
 
539 aa  643    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3397  chaperonin GroEL  62.93 
 
 
545 aa  649    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0555  chaperonin GroEL  62.93 
 
 
545 aa  649    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.22128  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0019  chaperonin GroEL  61.48 
 
 
553 aa  651    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.557028  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3660  chaperonin GroEL  62.15 
 
 
545 aa  647    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000280031  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  61.36 
 
 
546 aa  642    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0604  chaperonin GroEL  60.8 
 
 
551 aa  654    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390233  normal  0.0849194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0733  chaperonin GroEL  62.05 
 
 
546 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0551266  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6392  chaperonin GroEL  60.75 
 
 
540 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0385642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57010  chaperonin GroEL  64.15 
 
 
547 aa  666    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  60.26 
 
 
542 aa  640    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  60.48 
 
 
541 aa  650    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  61.14 
 
 
539 aa  640    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0860  chaperonin GroEL  62.43 
 
 
546 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3522  chaperonin GroEL  61.29 
 
 
546 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6251  chaperonin GroEL  60.48 
 
 
540 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.775744 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  61.89 
 
 
543 aa  656    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2345  chaperonin GroEL  62.26 
 
 
542 aa  641    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000515051  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3567  chaperonin GroEL  62.93 
 
 
545 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0280431  decreased coverage  0.00325194 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  65.75 
 
 
539 aa  682    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0701  chaperonin GroEL  61.77 
 
 
545 aa  647    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.393855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  60.42 
 
 
554 aa  655    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1936  chaperonin GroEL  61.74 
 
 
547 aa  654    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  62.02 
 
 
541 aa  650    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>