More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1089 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  65.23 
 
 
544 aa  676  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.89834e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5325  chaperonin GroEL  62.88 
 
 
546 aa  641  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589591  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  60.04 
 
 
548 aa  640  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  4.41199e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03703  chaperonin GroEL  61.87 
 
 
546 aa  657  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3427  chaperonin GroEL  60.93 
 
 
540 aa  651  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0579  chaperonin GroEL  62.78 
 
 
547 aa  665  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158784  normal  0.586113 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0864  chaperonin GroEL  62.05 
 
 
546 aa  644  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  1.44467e-05  normal  0.0762282 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  62.66 
 
 
550 aa  681  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2333  chaperonin GroEL  62.24 
 
 
546 aa  643  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0883149  normal  0.0155748 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1738  chaperonin GroEL  60.11 
 
 
548 aa  643  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.280539  decreased coverage  0.00152275 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1623  chaperonin GroEL  60.56 
 
 
547 aa  649  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757187  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2054  chaperonin GroEL  61.44 
 
 
544 aa  654  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6096  chaperonin GroEL  60.75 
 
 
540 aa  649  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3451  chaperonin GroEL  61.29 
 
 
546 aa  642  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201632  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0750  chaperonin GroEL  62.05 
 
 
546 aa  644  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.20211  normal  0.100291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0483  chaperonin GroEL  61.89 
 
 
549 aa  642  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3997  chaperonin GroEL  61.48 
 
 
546 aa  641  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.113268 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0586  chaperonin GroEL  63.35 
 
 
544 aa  661  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.82546  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0498  chaperonin GroEL  61.55 
 
 
547 aa  654  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  6.58221e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2929  chaperonin GroEL  59.96 
 
 
548 aa  650  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00334026  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0470  chaperonin GroEL  62.08 
 
 
547 aa  648  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0698  chaperonin GroEL  60.15 
 
 
551 aa  643  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  1.18072e-06  unclonable  8.6232e-11 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4727  chaperonin GroEL  61.03 
 
 
548 aa  639  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4608  chaperonin GroEL  61.03 
 
 
545 aa  639  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  59.2 
 
 
547 aa  645  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3661  chaperonin GroEL  63.48 
 
 
547 aa  678  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1470  chaperonin GroEL  62.5 
 
 
547 aa  659  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63644  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03918  chaperonin GroEL  62.92 
 
 
546 aa  663  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4600  chaperonin GroEL  61.03 
 
 
548 aa  639  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4748  chaperonin GroEL  61.03 
 
 
548 aa  639  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.729761  normal  0.333677 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3626  chaperonin GroEL  61.29 
 
 
549 aa  649  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0834  chaperonin GroEL  60.8 
 
 
547 aa  643  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  3.96118e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0680  chaperonin GroEL  61.55 
 
 
549 aa  643  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.156157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1331  chaperonin GroEL  63.69 
 
 
547 aa  652  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0783  chaperonin GroEL  61.74 
 
 
550 aa  649  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  3.75112e-05  normal  0.275175 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0308  chaperonin GroEL  59.33 
 
 
544 aa  644  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.541583 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1693  chaperonin GroEL  60.37 
 
 
547 aa  646  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.274413  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6727  chaperonin GroEL  60.3 
 
 
540 aa  649  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1771  chaperonin GroEL  61.74 
 
 
545 aa  641  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190882  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3679  chaperonin GroEL  61.54 
 
 
547 aa  654  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59981  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  64.46 
 
 
540 aa  654  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  4.47633e-05 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  64.77 
 
 
545 aa  648  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  64.65 
 
 
540 aa  671  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0409  chaperonin GroEL  61.03 
 
 
548 aa  640  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0642  chaperonin GroEL  61.57 
 
 
549 aa  640  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0667  chaperonin GroEL  62.06 
 
 
544 aa  654  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  60.96 
 
 
543 aa  664  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0287  chaperonin GroEL  60.3 
 
 
552 aa  650  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  3.93634e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4264  chaperonin GroEL  62.87 
 
 
543 aa  642  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154167  normal  0.0469061 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  64.49 
 
 
538 aa  696  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0308  chaperonin GroEL  61.68 
 
 
544 aa  651  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0755477  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0568  chaperonin GroEL  60.93 
 
 
543 aa  652  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  4.40547e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3675  chaperonin GroEL  61.44 
 
 
548 aa  642  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0509  chaperonin GroEL  61.5 
 
 
545 aa  653  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  3.31966e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  62.62 
 
 
547 aa  671  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0672  chaperonin GroEL  63.12 
 
 
545 aa  652  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342716  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5661  chaperonin GroEL  62.17 
 
 
547 aa  649  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00217744  hitchhiker  0.00916783 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2528  chaperonin GroEL  62.62 
 
 
546 aa  648  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0382557 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0831  chaperonin GroEL  62.24 
 
 
546 aa  645  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00374886  decreased coverage  3.89435e-06 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4308  chaperonin GroEL  61.61 
 
 
550 aa  642  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0534  chaperonin GroEL  62.5 
 
 
546 aa  642  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.282676  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0968  chaperonin GroEL  62.83 
 
 
546 aa  655  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.140155 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  64.55 
 
 
538 aa  692  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3822  chaperonin GroEL  61.44 
 
 
548 aa  642  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  63.55 
 
 
547 aa  642  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4150  chaperonin GroEL  62.52 
 
 
548 aa  645  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00153421  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4488  chaperonin GroEL  62.59 
 
 
547 aa  654  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0309413  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  64.38 
 
 
541 aa  699  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  65.11 
 
 
544 aa  674  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4782  chaperonin GroEL  62.62 
 
 
546 aa  641  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3334  chaperonin GroEL  61.94 
 
 
540 aa  644  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0741  chaperonin GroEL  61.99 
 
 
548 aa  642  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0722  chaperonin GroEL  61.44 
 
 
548 aa  642  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1908  chaperonin GroEL  60.11 
 
 
552 aa  650  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1472  chaperonin GroEL  63.53 
 
 
547 aa  666  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0166914  normal  0.319334 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3205  chaperonin GroEL  60 
 
 
576 aa  639  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6589  chaperonin GroEL  61.96 
 
 
554 aa  663  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5367  chaperonin GroEL  61.26 
 
 
538 aa  644  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475271  normal  0.589855 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0728  chaperonin GroEL  61.03 
 
 
548 aa  643  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  64.72 
 
 
538 aa  676  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  64.7 
 
 
539 aa  682  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2176  chaperonin GroEL  61.55 
 
 
549 aa  655  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.901834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  63.21 
 
 
546 aa  654  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  65.19 
 
 
538 aa  687  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  7.3104e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2624  chaperonin GroEL  63.07 
 
 
545 aa  672  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0317  chaperonin GroEL  62.64 
 
 
544 aa  656  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000185818  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6245  chaperonin GroEL  62.64 
 
 
544 aa  674  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  62.52 
 
 
540 aa  669  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  62.5 
 
 
544 aa  664  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  64.04 
 
 
540 aa  656  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0243  chaperonin GroEL  62.19 
 
 
547 aa  648  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.649661  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2734  chaperonin GroEL  61.8 
 
 
543 aa  650  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.657251 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0706  chaperonin GroEL  63.12 
 
 
541 aa  653  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27717  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002225  heat shock protein 60 family chaperone GroEL  61.24 
 
 
548 aa  649  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1918  chaperonin GroEL  63.24 
 
 
540 aa  689  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00670  chaperonin GroEL  62.57 
 
 
544 aa  642  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0610  chaperonin GroEL  92.54 
 
 
546 aa  991  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.912876  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4199  chaperonin GroEL  62.64 
 
 
543 aa  648  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3298  chaperonin GroEL  65.69 
 
 
539 aa  677  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.41528  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0204  chaperonin GroEL  61.96 
 
 
543 aa  661  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>