More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4946 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 277 aa  518  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  71.91 
 
 		 277 aa  338  8e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  71.54 
 
 		 276 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  70.79 
 
 		 277 aa  332  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  67.04 
 
 		 272 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  67.79 
 
 		 277 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.63 
 
 		 273 aa  259  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.47 
 
 		 301 aa  258  7e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.55 
 
 		 278 aa  258  9e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.2 
 
 		 276 aa  255  5e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.25 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.47 
 
 		 273 aa  252  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.51 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.6 
 
 		 266 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.84 
 
 		 281 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.83 
 
 		 274 aa  238  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.45 
 
 		 273 aa  232  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.43 
 
 		 278 aa  225  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.32 
 
 		 274 aa  218  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.13 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.5 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.79 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.74 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.05 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.63 
 
 		 273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.15 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.29 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  50 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.73 
 
 		 280 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.07 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.07 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.68 
 
 		 273 aa  176  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.21 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.73 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.89 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  50 
 
 		 267 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.87 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 		 289 aa  162  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.89 
 
 		 289 aa  161  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.85 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.75 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.26 
 
 		 269 aa  159  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.96 
 
 		 275 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2704  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.85 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.41 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 		 267 aa  155  9e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  40.89 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.55 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.96 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.28 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.13 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1285  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.19 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.62 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.29 
 
 		 272 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  40.89 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0764  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.1 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0160  pyrroline-5-carboxylate reductase  39 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0045  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.23 
 
 		 286 aa  149  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.06 
 
 		 274 aa  149  6e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.06 
 
 		 274 aa  148  8e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.58 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3664  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.43 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.02 
 
 		 273 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4472  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.68 
 
 		 268 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.06 
 
 		 277 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.34 
 
 		 276 aa  145  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3795  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.89 
 
 		 269 aa  145  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.322832 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.53 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  38.43 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.26 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1142  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.66 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2668  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.79 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.97 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.88 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0475  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.42 
 
 		 278 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  37.59 
 
 		 283 aa  142  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.13 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1437  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.43 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.85 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.06 
 
 		 277 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.08 
 
 		 273 aa  138  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.5 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0937  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.1 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0677  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.42 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.59 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.33 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.52 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3513  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.7 
 
 		 267 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.7 
 
 		 272 aa  135  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>