More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4367 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
313 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.07 
 
 
313 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18831  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5121  putative ABC transporter permease protein  79.19 
 
 
298 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.407731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.22 
 
 
313 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.86 
 
 
313 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  63.26 
 
 
313 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  63.58 
 
 
313 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.7 
 
 
313 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.22 
 
 
313 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.62 
 
 
313 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.98 
 
 
313 aa  374  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5089  branched-chain amino acid ABC transporter membrane protein  61.54 
 
 
311 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.242511  normal  0.40775 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.09 
 
 
315 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  58.71 
 
 
313 aa  361  7.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.15 
 
 
314 aa  355  7.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.29 
 
 
311 aa  348  7e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.893749  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.55 
 
 
313 aa  342  5e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.589529  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1866  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.97 
 
 
311 aa  335  5.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.153142  normal  0.0602666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1498  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.72 
 
 
308 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.88 
 
 
313 aa  297  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.32 
 
 
313 aa  295  8e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.25 
 
 
317 aa  294  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.650589  normal  0.092891 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.84 
 
 
313 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.8 
 
 
313 aa  291  8e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.88 
 
 
313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.92 
 
 
313 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  46.33 
 
 
314 aa  277  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5088  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  48.88 
 
 
313 aa  271  8.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 
334 aa  271  9e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.73 
 
 
306 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  44.91 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.41 
 
 
306 aa  267  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.61 
 
 
336 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  44.31 
 
 
336 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.05 
 
 
306 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.77 
 
 
306 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221048  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  44.61 
 
 
336 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.41 
 
 
313 aa  266  5e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  43.13 
 
 
306 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.45 
 
 
311 aa  265  5.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  43.13 
 
 
306 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0323  ABC transporter permease protein  43.77 
 
 
306 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  43.13 
 
 
306 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1766  putative glutathione ABC transporter, permease protein  43.77 
 
 
306 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0976  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  43.77 
 
 
306 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00545821  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1357  putative glutathione ABC transporter, permease protein  43.77 
 
 
306 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.22 
 
 
306 aa  265  8e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.45 
 
 
306 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.17239  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1851  ABC transport permease  43.77 
 
 
306 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0240  putative glutathione ABC transporter, permease protein  43.77 
 
 
306 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.45 
 
 
306 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.191651  hitchhiker  0.00741174 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0400  putative glutathione ABC transporter, permease protein  43.77 
 
 
306 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.668867  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.61 
 
 
336 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.77 
 
 
306 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.61 
 
 
336 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  44.61 
 
 
336 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.18 
 
 
334 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  42.81 
 
 
306 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  42.81 
 
 
306 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.28 
 
 
313 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.94 
 
 
306 aa  264  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7327  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  44.41 
 
 
306 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.01 
 
 
309 aa  263  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.9 
 
 
306 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.13 
 
 
306 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.856308  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  43.11 
 
 
336 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1114  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  43.45 
 
 
327 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1866  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  43.45 
 
 
306 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal  0.486498 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.24 
 
 
334 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.74 
 
 
333 aa  260  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  43.77 
 
 
307 aa  259  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  42.51 
 
 
336 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.73 
 
 
308 aa  259  4e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.13 
 
 
306 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.913097  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.13 
 
 
306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  42.69 
 
 
337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.47 
 
 
314 aa  258  6e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.935308  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.77 
 
 
307 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525141  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  42.17 
 
 
306 aa  258  9e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  42.17 
 
 
306 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.17 
 
 
306 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.17 
 
 
306 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  42.17 
 
 
306 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.85 
 
 
306 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.579769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  42.17 
 
 
306 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  42.17 
 
 
306 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.77 
 
 
307 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  42.17 
 
 
306 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  41.54 
 
 
339 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  41.25 
 
 
339 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  41.25 
 
 
339 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  42.51 
 
 
336 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  41.25 
 
 
339 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  41.25 
 
 
339 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  41.42 
 
 
315 aa  255  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  41.85 
 
 
306 aa  255  8e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  41.25 
 
 
339 aa  255  9e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  40.95 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  40.95 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  40.95 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>