287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3726 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3726  ribosome-binding factor A  100 
 
 
142 aa  281  3e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2818  ribosome-binding factor A  86.62 
 
 
145 aa  241  2e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259467  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2922  ribosome-binding factor A  85.21 
 
 
145 aa  239  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0301917  normal  0.0601013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2696  ribosome-binding factor A  87.68 
 
 
145 aa  238  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.674256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2610  ribosome-binding factor A  83.33 
 
 
139 aa  214  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4619  ribosome-binding factor A  84.92 
 
 
135 aa  209  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0230  ribosome-binding factor A  65.41 
 
 
136 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00202036  normal  0.436051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0601  ribosome-binding factor A  64.62 
 
 
135 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0439  ribosome-binding factor A  63.64 
 
 
137 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0032  ribosome-binding factor A  63.91 
 
 
137 aa  164  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0058  ribosome-binding factor A  64.06 
 
 
138 aa  164  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0025  ribosome-binding factor A  67.72 
 
 
146 aa  160  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0481  ribosome-binding factor A  65.6 
 
 
137 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214856  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0292  ribosome-binding factor A  65 
 
 
151 aa  156  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.887654  normal  0.0167928 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1046  ribosome-binding factor A  59.5 
 
 
141 aa  151  3e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12886  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2294  ribosome-binding factor A  59.66 
 
 
155 aa  147  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.121706 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2799  ribosome-binding factor A  56.93 
 
 
138 aa  145  2e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.285538  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2924  ribosome-binding factor A  56.15 
 
 
165 aa  140  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332986  normal  0.135151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2768  ribosome-binding factor A  54.41 
 
 
137 aa  137  5e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1106  ribosome-binding factor A  54.62 
 
 
140 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0613  ribosome-binding factor A  51.85 
 
 
136 aa  134  3e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.440259  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3041  ribosome-binding factor A  54.69 
 
 
135 aa  132  1e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.603703  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3815  ribosome-binding factor A  53.91 
 
 
132 aa  130  7e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104911  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3442  ribosome-binding factor A  52.38 
 
 
134 aa  130  8e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.728771  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4066  ribosome-binding factor A  50.79 
 
 
134 aa  126  1e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0086  ribosome-binding factor A  53.33 
 
 
131 aa  125  1e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744834  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0170  ribosome-binding factor A  49.63 
 
 
137 aa  125  2e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0610976  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4386  ribosome-binding factor A  50 
 
 
134 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.4784 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0746  ribosome-binding factor A  50 
 
 
150 aa  124  4e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321784  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2166  ribosome-binding factor A  54.1 
 
 
150 aa  122  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2078  ribosome-binding factor A  53.66 
 
 
197 aa  122  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4036  ribosome-binding factor A  46.15 
 
 
143 aa  117  5e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3046  ribosome-binding factor A  47.24 
 
 
141 aa  114  4e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3931  ribosome-binding factor A  50.83 
 
 
133 aa  113  8e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0038  ribosome-binding factor A  42.31 
 
 
164 aa  112  2e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623045  normal  0.446494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3629  ribosome-binding factor A  50.39 
 
 
140 aa  110  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.445652  normal  0.0497582 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3782  ribosome-binding factor A  46.92 
 
 
164 aa  107  4e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0911878  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1255  ribosome-binding factor A  48.44 
 
 
148 aa  107  7e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2488  ribosome-binding factor A  46.88 
 
 
135 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.266682  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0226  ribosome-binding factor A  47.93 
 
 
140 aa  100  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  42.06 
 
 
123 aa  89.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2071  ribosome-binding factor A  44.26 
 
 
145 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.573719 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  42.75 
 
 
139 aa  71.6  3e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  38.76 
 
 
130 aa  70.1  9e-12  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  41.61 
 
 
138 aa  69.7  1e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  41.61 
 
 
138 aa  68.6  3e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 
132 aa  68.2  4e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.64371e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1748  ribosome-binding factor A  42.06 
 
 
126 aa  66.2  1e-10  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0187668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  27.64 
 
 
123 aa  66.2  1e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1143  ribosome-binding factor A  40.18 
 
 
122 aa  65.9  2e-10  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  34.23 
 
 
118 aa  65.5  2e-10  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002610  ribosome-binding factor A  35.38 
 
 
131 aa  65.5  2e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  31.93 
 
 
118 aa  64.7  4e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 
119 aa  64.7  4e-10  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 
119 aa  64.7  4e-10  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 
127 aa  64.3  6e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0610  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 
128 aa  63.9  7e-10  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0012936  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0998  ribosome-binding factor A  35.43 
 
 
126 aa  63.9  7e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00108919  normal  0.25507 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03395  ribosome-binding factor A  34.35 
 
 
137 aa  63.5  9e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 
118 aa  63.5  1e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 
118 aa  63.2  1e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 
118 aa  63.2  1e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.6841e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 
118 aa  62.8  2e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  33.09 
 
 
129 aa  62.4  2e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4876  ribosome-binding factor A  33.93 
 
 
127 aa  62  2e-09  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.26776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  36.7 
 
 
156 aa  62.4  2e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 
118 aa  62.8  2e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.32995e-63 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  38.18 
 
 
131 aa  62.4  2e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  40.37 
 
 
121 aa  62.4  2e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 
118 aa  62.8  2e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 
118 aa  62  3e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 
118 aa  62  3e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  34.86 
 
 
118 aa  61.6  3e-09  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  31.3 
 
 
120 aa  61.6  3e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  38.74 
 
 
121 aa  62  3e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  32.81 
 
 
141 aa  61.6  4e-09  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1124  ribosome-binding factor A  34.55 
 
 
121 aa  61.2  5e-09  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.559774  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  31.5 
 
 
132 aa  60.8  5e-09  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  30.65 
 
 
131 aa  61.2  5e-09  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.45103e-05  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 
118 aa  60.8  6e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 
118 aa  60.8  6e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  32.11 
 
 
118 aa  60.8  6e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  30.28 
 
 
122 aa  60.8  7e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0175  ribosome-binding factor A  35.19 
 
 
136 aa  60.5  8e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.146816  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  31.2 
 
 
125 aa  60.1  9e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1461  ribosome-binding factor A  32.28 
 
 
123 aa  60.5  9e-09  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00371256  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  34.43 
 
 
127 aa  60.1  1e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  30.91 
 
 
127 aa  59.7  1e-08  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  28.18 
 
 
119 aa  58.9  2e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  28.18 
 
 
119 aa  59.3  2e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3680  ribosome-binding factor A  34.13 
 
 
127 aa  58.9  2e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00259102  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  31.25 
 
 
133 aa  58.9  2e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  31.48 
 
 
126 aa  58.9  2e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  8.26248e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 
159 aa  58.9  3e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0955  ribosome-binding factor A  34.11 
 
 
125 aa  58.5  3e-08  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.676636  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 
133 aa  58.5  3e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3752  ribosome-binding factor A  37.4 
 
 
130 aa  58.5  3e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00104734  unclonable  1.34979e-05 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  36.94 
 
 
133 aa  58.5  3e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  28.18 
 
 
122 aa  58.2  4e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0466  ribosome-binding factor A  27.93 
 
 
115 aa  57.8  5e-08  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>