More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1816 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  81 
 
 		 228 aa  359  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2206  ABC transporter related  78.64 
 
 		 240 aa  352  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  79.73 
 
 		 250 aa  350  8.999999999999999e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  79.28 
 
 		 242 aa  348  5e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  77.13 
 
 		 238 aa  345  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  76.92 
 
 		 236 aa  344  8e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  79.55 
 
 		 233 aa  343  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3413  ABC transporter related  77.06 
 
 		 237 aa  339  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3019  ABC transporter-related protein  76.26 
 
 		 237 aa  337  5.9999999999999996e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3030  ABC transporter related  79 
 
 		 200 aa  319  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0284091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2131  ABC transporter, ATP-binding protein  69.16 
 
 		 238 aa  290  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  65.04 
 
 		 234 aa  286  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  65.16 
 
 		 227 aa  285  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1385  ABC transporter related  66.96 
 
 		 232 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00534091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  64.71 
 
 		 227 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  63.68 
 
 		 228 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  63.68 
 
 		 228 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  65.92 
 
 		 228 aa  280  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  63.39 
 
 		 227 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  68.3 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2309  ABC transporter, ATP-binding protein  68.3 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  68.3 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  68.3 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  68.3 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  68.3 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2467  ABC transporter, ATP-binding protein  67.41 
 
 		 238 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  65.02 
 
 		 228 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  63.23 
 
 		 227 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1718  ABC transporter ATP-binding protein  67.73 
 
 		 236 aa  271  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.529173  normal  0.324708 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1018  ABC transporter related  64.57 
 
 		 228 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  62.21 
 
 		 228 aa  271  5.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1529  ABC transporter related  67.27 
 
 		 236 aa  271  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.787332  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1862  ABC transporter related  66.82 
 
 		 236 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203223 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5219  ABC transporter, ATPase subunit  66.07 
 
 		 237 aa  268  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23060  ABC transporter ATP-binding protein  63.84 
 
 		 226 aa  268  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6161  ABC transporter related  65.04 
 
 		 237 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.455478  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1836  ABC transporter related  65.04 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175217 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1906  ABC transporter related  64.6 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1356  ABC transporter related  64.32 
 
 		 233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0383519  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4015  ABC transporter-like  63.23 
 
 		 227 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527031  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  59.17 
 
 		 228 aa  261  8e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1941  ABC transporter related  66.2 
 
 		 224 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1918  ABC transporter related  65.74 
 
 		 224 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  59.09 
 
 		 239 aa  258  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2559  ABC transporter related  64.71 
 
 		 227 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000178082  hitchhiker  0.000000000000206732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  60.54 
 
 		 227 aa  258  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0939  ABC transporter related  58.06 
 
 		 224 aa  257  8e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2553  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  59.91 
 
 		 237 aa  256  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2067  ABC transporter  60.54 
 
 		 227 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168595  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  62.84 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3445  ABC transporter, ATP-binding protein  56.88 
 
 		 226 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937681  hitchhiker  0.0000228782 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  61.29 
 
 		 239 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  54.05 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  56.56 
 
 		 237 aa  249  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1880  ABC transporter-related protein  72.58 
 
 		 195 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.234767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  56.62 
 
 		 249 aa  248  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0009  ABC transporter related protein  60.73 
 
 		 233 aa  246  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  54.84 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  56.68 
 
 		 249 aa  245  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  54.84 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 		 225 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  59.35 
 
 		 219 aa  244  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  59.72 
 
 		 219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  55.05 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  55.3 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  53.39 
 
 		 242 aa  240  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  53.39 
 
 		 246 aa  240  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  53.39 
 
 		 242 aa  240  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  53.39 
 
 		 242 aa  240  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  56.48 
 
 		 230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  56.62 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  54.34 
 
 		 250 aa  238  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  56.94 
 
 		 235 aa  236  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  55.71 
 
 		 224 aa  236  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  56.05 
 
 		 230 aa  235  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0969  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  56.56 
 
 		 228 aa  235  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  52.94 
 
 		 251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  54.17 
 
 		 249 aa  234  8e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  53.42 
 
 		 249 aa  234  8e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  54.17 
 
 		 249 aa  234  8e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  54.17 
 
 		 253 aa  234  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1045  ABC transporter related  59.28 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  56.11 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  53.46 
 
 		 227 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000167  predicted ABC-type transport system ATPase component  53.85 
 
 		 230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.780039  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  56.11 
 
 		 228 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  54.3 
 
 		 224 aa  232  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  56.11 
 
 		 228 aa  231  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  56.11 
 
 		 228 aa  231  6e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  56.11 
 
 		 228 aa  231  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  56.11 
 
 		 228 aa  231  6e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02303  putative Lipoprotein releasing system ATP-binding component of ABC transporter  52.27 
 
 		 232 aa  231  6e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  56.11 
 
 		 228 aa  231  6e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  56.11 
 
 		 228 aa  231  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  56.11 
 
 		 228 aa  231  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  56.11 
 
 		 228 aa  231  6e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  56.11 
 
 		 228 aa  231  6e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1123  ABC transporter related  54.3 
 
 		 243 aa  231  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0137163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>