174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4296 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  65.6 
 
 
530 aa  749    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  73.59 
 
 
597 aa  882    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  73.68 
 
 
604 aa  883    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  73.51 
 
 
604 aa  881    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  74.08 
 
 
562 aa  891    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  73.51 
 
 
558 aa  879    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  58.68 
 
 
534 aa  635    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  60.69 
 
 
534 aa  636    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  61.38 
 
 
525 aa  655    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  74.08 
 
 
562 aa  891    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  76.49 
 
 
594 aa  882    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  100 
 
 
568 aa  1184    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  74.08 
 
 
608 aa  892    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  74.08 
 
 
562 aa  891    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  58.78 
 
 
534 aa  632  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  55.36 
 
 
534 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  56.85 
 
 
537 aa  599  1e-170  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  54.78 
 
 
560 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  55.71 
 
 
507 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  55.56 
 
 
560 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1038  glucan biosynthesis protein D  43.77 
 
 
542 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.667596 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1971  glucan biosynthesis protein D  44.57 
 
 
551 aa  439  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01381  glucan biosynthesis protein, periplasmic  43.96 
 
 
541 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2222  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  43.96 
 
 
539 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.834174  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  45.38 
 
 
498 aa  431  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1649  glucan biosynthesis protein D  42.81 
 
 
551 aa  431  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1535  glucan biosynthesis protein D  45.11 
 
 
539 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.603561  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01393  hypothetical protein  42.81 
 
 
551 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1740  glucan biosynthesis protein D  45.11 
 
 
539 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2029  glucan biosynthesis protein D  43.96 
 
 
539 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.511288  hitchhiker  0.0000000000014294 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1800  glucan biosynthesis protein D  45.11 
 
 
539 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1736  glucan biosynthesis protein D  45.11 
 
 
539 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.403462  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1506  glucan biosynthesis protein D  42.81 
 
 
551 aa  430  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1603  glucan biosynthesis protein D  42.81 
 
 
551 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1750  glucan biosynthesis protein D  43.96 
 
 
539 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5781800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2235  glucan biosynthesis protein D  43.96 
 
 
539 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.720704 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0218  glucan biosynthesis protein D  42.07 
 
 
550 aa  425  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.451813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1720  glucan biosynthesis protein D  44.92 
 
 
539 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.29319 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5542  periplasmic glucan biosynthesis protein, putative  43.71 
 
 
539 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5085  glucan biosynthesis protein D  43.11 
 
 
539 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3122  glucan biosynthesis protein D  42.31 
 
 
551 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4893  glucan biosynthesis protein D  45.92 
 
 
518 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1830  glucan biosynthesis protein D  47.97 
 
 
519 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  43.72 
 
 
532 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  44.14 
 
 
542 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3964  glucan biosynthesis protein D  43.58 
 
 
537 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4077  glucan biosynthesis protein D  43.58 
 
 
537 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.608962 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0143  glucan biosynthesis protein D  42.67 
 
 
543 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  42.59 
 
 
551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4673  glucan biosynthesis protein D  47.69 
 
 
540 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  43.26 
 
 
528 aa  403  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  41.96 
 
 
534 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  44.15 
 
 
495 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3273  glucan biosynthesis protein D  45.36 
 
 
532 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0778178  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  41.96 
 
 
503 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  41.96 
 
 
503 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  41.43 
 
 
519 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  42.36 
 
 
588 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3185  glucan biosynthesis protein D  44.63 
 
 
527 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  42.65 
 
 
519 aa  393  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  41.41 
 
 
533 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  41.31 
 
 
544 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3187  glucan biosynthesis protein D  43.87 
 
 
531 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3145  glucan biosynthesis protein D  43.18 
 
 
587 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680509  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3438  glucan biosynthesis protein D  43.13 
 
 
545 aa  386  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  43.67 
 
 
525 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3925  glucan biosynthesis protein D  43.87 
 
 
527 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324166  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0309  glucan biosynthesis protein D  44.26 
 
 
524 aa  385  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1158  glucan biosynthesis protein G  41.48 
 
 
527 aa  388  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.025306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  43.67 
 
 
525 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  43.52 
 
 
505 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  42.74 
 
 
504 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  44.47 
 
 
604 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  43.58 
 
 
545 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  43.58 
 
 
545 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  43.58 
 
 
545 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1081  glucan biosynthesis protein G  39.31 
 
 
533 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.418062  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  39.29 
 
 
528 aa  385  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  43.79 
 
 
498 aa  381  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  42.94 
 
 
517 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  42.94 
 
 
517 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  42.94 
 
 
517 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  42.94 
 
 
517 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  42.94 
 
 
517 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  42.09 
 
 
520 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  42.06 
 
 
540 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  41.46 
 
 
533 aa  381  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  42.09 
 
 
530 aa  382  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  42.74 
 
 
511 aa  379  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  42.74 
 
 
517 aa  379  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  42.74 
 
 
517 aa  379  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  41.39 
 
 
642 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  42.74 
 
 
511 aa  379  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  42.74 
 
 
517 aa  379  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  39.49 
 
 
545 aa  378  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  41.18 
 
 
511 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  42.74 
 
 
511 aa  378  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  42.74 
 
 
511 aa  378  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  42.74 
 
 
511 aa  378  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  42.74 
 
 
511 aa  378  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>