296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3567 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3567  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 
137 aa  263  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  58.33 
 
 
103 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  38.36 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  55.56 
 
 
97 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  54.44 
 
 
97 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  54.44 
 
 
97 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  50 
 
 
375 aa  98.2  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  53.49 
 
 
139 aa  97.4  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  36.96 
 
 
161 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  51.61 
 
 
372 aa  95.9  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  37.67 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  50 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  50 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  44.94 
 
 
226 aa  94  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  48.24 
 
 
393 aa  94  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 
99 aa  93.6  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  36.3 
 
 
152 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4201  flagellar motor switch protein FliN  52.44 
 
 
103 aa  93.6  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  35.62 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  37.5 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0422  flagellar motor switch protein FliN  46.74 
 
 
101 aa  92  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  43.62 
 
 
154 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  43.62 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3910  flagellar motor switch protein FliN  49.41 
 
 
101 aa  92  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3826  flagellar motor switch protein FliN  49.41 
 
 
101 aa  92  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  41.22 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  45.24 
 
 
154 aa  92  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  44.09 
 
 
155 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3438  flagellar motor switch protein FliN  48.81 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  48.24 
 
 
401 aa  90.5  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  51.16 
 
 
188 aa  90.9  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3099  flagellar motor switch FliN  48.86 
 
 
101 aa  90.5  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  39.23 
 
 
175 aa  90.5  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  48.19 
 
 
111 aa  90.1  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  44.05 
 
 
157 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  44.05 
 
 
157 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  43.4 
 
 
190 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  51.19 
 
 
422 aa  90.1  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  47.62 
 
 
111 aa  90.1  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  48.19 
 
 
109 aa  90.1  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  51.81 
 
 
357 aa  89.7  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  45.88 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  44.58 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  42.27 
 
 
131 aa  89.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  45.78 
 
 
126 aa  88.6  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  39.18 
 
 
174 aa  89  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  44.05 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  45.78 
 
 
127 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  45.78 
 
 
129 aa  88.2  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  44.55 
 
 
137 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0056  flagellar motor switch protein FliY  51.76 
 
 
273 aa  87.8  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.82232  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  45.78 
 
 
127 aa  88.2  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  44.34 
 
 
175 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0069  flagellar motor switch protein FliY  51.76 
 
 
273 aa  87.8  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0097  flagellar motor switch protein FliY  51.76 
 
 
273 aa  87.8  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  44.71 
 
 
131 aa  87.8  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  37.7 
 
 
127 aa  87.8  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 
136 aa  87.8  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  39.36 
 
 
166 aa  87.8  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  42.11 
 
 
180 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  50 
 
 
411 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  44.58 
 
 
127 aa  87  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  33.56 
 
 
153 aa  87.4  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  44.58 
 
 
124 aa  87  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  47.67 
 
 
398 aa  87  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  45.05 
 
 
378 aa  87  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  44.58 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  44.58 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  44.58 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  44.71 
 
 
136 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  44.58 
 
 
124 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  44.58 
 
 
124 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  44.71 
 
 
136 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  44.58 
 
 
124 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  44.58 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  47.62 
 
 
170 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  37.6 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  44.05 
 
 
203 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  38.89 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0582  flagellar motor switch protein FliN  52.63 
 
 
109 aa  85.9  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  43.56 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  44.58 
 
 
127 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  43.56 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  43.56 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  43.56 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0238  flagellar motor switch protein FliY  49.41 
 
 
279 aa  85.9  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  44.58 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  43.56 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  48.19 
 
 
375 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  43.56 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  43.56 
 
 
137 aa  85.5  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  46.43 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  45.12 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  46.43 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  43.53 
 
 
127 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  34.13 
 
 
162 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  46.43 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  46.43 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  34.13 
 
 
162 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  45.24 
 
 
137 aa  84.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>