More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3424 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  100 
 
 		 92 aa  177  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  50.57 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  49.43 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  50 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  44.57 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  44.57 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  45.35 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  44.57 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  44.57 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 88 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 88 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 88 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  43.68 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0001  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  43.96 
 
 		 91 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_002978  WD1150  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00399464  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  45.56 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0001  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  41.57 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  44.57 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  44.57 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  44.57 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  44.57 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00027  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000413778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0025  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.87642e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  45.98 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  43.82 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  67  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0582  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  67  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000160392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3655  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 87 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225514  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0792  ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  67  0.00000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3849  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 87 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.716428  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2893  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.204979  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3079  SSU ribosomal protein S20P  41.38 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0239933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0921  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000253205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  45.05 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  47.13 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0071  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2726  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000316732  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  45.56 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  45.56 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0041  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.418613  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0048  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000398649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0047  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000872417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0047  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000090572  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0048  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000161385  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0047  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000542728  normal  0.0144218 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1288  30S ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000699661  normal  0.326601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5203  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.614694  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  39.13 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  44.83 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3031  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.362644  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3037  ribosomal protein S20p  35.63 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.083141  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1080  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000335633  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0577  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000729927  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004422  SSU ribosomal protein S20p  43.02 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000816133  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>