54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3336 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3336  OstA family protein  100 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2168  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.76 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  28.99 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0508  OstA family protein  34.44 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.346357  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  32.19 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  38.2 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  30.06 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  31.36 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2974  OstA family protein  27.47 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000275423  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1603  OstA family protein  27.98 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3392  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.86 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.4 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0151  hypothetical protein  30.87 
 
 		 216 aa  57  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0300186  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0156  hypothetical protein  30.87 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0194  cell envelope biogenesis YhbN  27.97 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106383  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0867  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  33.57 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778662  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1155  OstA-like protein  30.88 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  30.25 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2816  OstA family protein  30.88 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  28.91 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  27.14 
 
 		 225 aa  51.6  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0454  cell envelope biogenesis protein YhbN  27.97 
 
 		 161 aa  51.6  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2341  OstA-like protein  24.49 
 
 		 191 aa  51.2  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1940  hypothetical protein  31.97 
 
 		 166 aa  51.2  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.946021  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1769  hypothetical protein  24.67 
 
 		 179 aa  51.2  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0429  OstA family protein  23.35 
 
 		 224 aa  50.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.034618 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2606  OstA family protein  29.93 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0570  OstA family protein  25.37 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0728  OstA-like protein  25.86 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  26.95 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2905  OstA family protein  26.45 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  29.73 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  28.68 
 
 		 228 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  27.91 
 
 		 219 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0152  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.49 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  27.69 
 
 		 221 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1175  hypothetical protein  25.42 
 
 		 172 aa  47.8  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5469  OstA family protein  27.38 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  24 
 
 		 275 aa  46.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2772  OstA family protein  27.21 
 
 		 168 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2499  OstA family protein  27.27 
 
 		 242 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.241313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3669  OstA-like protein  22.73 
 
 		 186 aa  44.7  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3249  OstA-like protein  25.81 
 
 		 184 aa  44.7  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1507  OstA family protein  28.28 
 
 		 196 aa  44.3  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  decreased coverage  0.000611674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2722  OstA family protein  25.9 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1369  OstA family protein  23.53 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.524769  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0406  cell envelope biogenesis protein YhbN  29.46 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2427  OstA family protein  25.9 
 
 		 250 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0150816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0877  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.74 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000011507  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5924  OstA family protein  25 
 
 		 239 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657817  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2071  OstA family protein  27.21 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0535  OstA-like family protein  28.08 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.872333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  25.36 
 
 		 225 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0107  OstA family protein  34.07 
 
 		 180 aa  41.2  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.587032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>