29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1769 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1769  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  370  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0429  OstA family protein  43.98 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.034618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1507  OstA family protein  45.34 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  decreased coverage  0.000611674 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0152  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  38.92 
 
 		 175 aa  124  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1603  OstA family protein  35.67 
 
 		 181 aa  104  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  25.81 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  24.16 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2168  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.16 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  20.11 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  22.3 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0867  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778662  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1660  OstA-like protein  28.26 
 
 		 760 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3392  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.14 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3336  OstA family protein  24.67 
 
 		 179 aa  51.2  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2071  OstA family protein  26.14 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002405  LptA protein  30.16 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122787  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4314  OstA family protein  27.74 
 
 		 186 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.257817 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2606  OstA family protein  30.71 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2816  OstA family protein  25.53 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1155  OstA-like protein  25.53 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03662  hypothetical protein  26.98 
 
 		 164 aa  44.7  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0025  OstA-like protein  25.64 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00942039  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2635  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.05 
 
 		 182 aa  44.7  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3027  hypothetical protein  28.05 
 
 		 182 aa  44.7  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2107  hypothetical protein  27.08 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1489  OstA-like protein  23.67 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0428752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1940  hypothetical protein  29.49 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.946021  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0728  OstA-like protein  26.76 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1077  OstA-like protein  25.88 
 
 		 166 aa  42  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>