36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0051 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 97 aa  181  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  47.92 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  44.68 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  44.33 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  37.89 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  39.78 
 
 		 247 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  35.79 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  34.78 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  29.47 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  33.72 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  32.26 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  42.11 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  31.25 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  34.38 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  32.63 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  32.63 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  30.53 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  30.11 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  31.18 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  34.21 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  38.16 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  32.58 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  32.65 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1656  DNA polymerase beta domain protein region  38.6 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  26.88 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  30.61 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0872  DNA polymerase beta subunit  28.4 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178171  hitchhiker  0.0000000998415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0551  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1370  DNA polymerase beta subunit  44.44 
 
 		 241 aa  42  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0334218 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  36.67 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0404  nucleotidyltransferase domain-containing protein  36.59 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.108066  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  50 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0336  DNA polymerase beta domain protein region  48.72 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  29.49 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  34.12 
 
 		 549 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>