More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0062 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0759  alanine dehydrogenase  93.83 
 
 
373 aa  665    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1159  alanine dehydrogenase  93.3 
 
 
373 aa  661    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0062  alanine dehydrogenase  100 
 
 
373 aa  745    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.463029  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0825  alanine dehydrogenase  91.15 
 
 
373 aa  643    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.110091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  71.58 
 
 
374 aa  535  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  68.9 
 
 
373 aa  531  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  68.19 
 
 
377 aa  529  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  68.19 
 
 
377 aa  524  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  68.19 
 
 
377 aa  524  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  68.19 
 
 
377 aa  524  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  68.19 
 
 
377 aa  524  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  68.19 
 
 
377 aa  524  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  68.19 
 
 
377 aa  524  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  68.46 
 
 
377 aa  526  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  68.19 
 
 
377 aa  524  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  68.19 
 
 
377 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  68.19 
 
 
377 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  68.19 
 
 
377 aa  523  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  67.92 
 
 
377 aa  522  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  67.92 
 
 
377 aa  521  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  68.28 
 
 
372 aa  524  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  68.19 
 
 
377 aa  522  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  68.19 
 
 
377 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  68.19 
 
 
377 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  67.92 
 
 
377 aa  523  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  68.19 
 
 
377 aa  523  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  68.19 
 
 
377 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  67.39 
 
 
377 aa  523  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  67.92 
 
 
377 aa  520  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2866  alanine dehydrogenase  73.39 
 
 
374 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245615  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  64.96 
 
 
371 aa  508  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  66.49 
 
 
377 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  65.31 
 
 
371 aa  500  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  67.56 
 
 
377 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5593  alanine dehydrogenase  65.23 
 
 
377 aa  477  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.74173  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  62.53 
 
 
372 aa  471  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  62.53 
 
 
372 aa  471  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  61.39 
 
 
376 aa  459  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  59.56 
 
 
390 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  60.65 
 
 
374 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  60.55 
 
 
370 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0984  alanine dehydrogenase  64.96 
 
 
370 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0509355  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0022  alanine dehydrogenase  60.44 
 
 
372 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  61.73 
 
 
371 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  58.97 
 
 
371 aa  436  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  61.1 
 
 
370 aa  432  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  53.64 
 
 
373 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  58.76 
 
 
374 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  56.87 
 
 
371 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  57.71 
 
 
376 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3009  alanine dehydrogenase  63.61 
 
 
368 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40821  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  57.81 
 
 
370 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21130  alanine dehydrogenase  64.69 
 
 
341 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  57.53 
 
 
370 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  57.26 
 
 
370 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  58.79 
 
 
371 aa  408  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1131  alanine dehydrogenase  56.33 
 
 
370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  55.53 
 
 
372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  54.25 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  57.68 
 
 
371 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  56.33 
 
 
370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3131  alanine dehydrogenase  54.97 
 
 
371 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0048846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2565  Alanine dehydrogenase  53.91 
 
 
371 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.502023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  53.12 
 
 
371 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  54.25 
 
 
371 aa  401  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  53.7 
 
 
371 aa  401  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  56.71 
 
 
371 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  54.25 
 
 
371 aa  401  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  55.89 
 
 
371 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  55.89 
 
 
371 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  55.89 
 
 
371 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0986  hypothetical protein  56.72 
 
 
373 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  55.89 
 
 
371 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0771  alanine dehydrogenase  60.65 
 
 
368 aa  399  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.316725  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  55.83 
 
 
376 aa  401  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  56.16 
 
 
371 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  56.44 
 
 
371 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  56.44 
 
 
371 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  54.25 
 
 
371 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0955  hypothetical protein  56.45 
 
 
373 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4118  alanine dehydrogenase  54.45 
 
 
371 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  53.64 
 
 
373 aa  395  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  55.49 
 
 
372 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  54.03 
 
 
371 aa  396  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3643  alanine dehydrogenase  54.72 
 
 
371 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2448  alanine dehydrogenase  54.62 
 
 
366 aa  393  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0568  alanine dehydrogenase  58.27 
 
 
376 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  55.87 
 
 
363 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1923  alanine dehydrogenase  54.18 
 
 
371 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1797  L-alanine dehydrogenase  54.45 
 
 
371 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  55.87 
 
 
363 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2747  alanine dehydrogenase  61.54 
 
 
367 aa  392  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.339433  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  54.55 
 
 
369 aa  394  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1177  alanine dehydrogenase  57.3 
 
 
362 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  56.6 
 
 
371 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  54.18 
 
 
371 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4430  alanine dehydrogenase  54.03 
 
 
371 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  52.83 
 
 
372 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  54.52 
 
 
366 aa  389  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3297  alanine dehydrogenase  53.64 
 
 
371 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>