38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0784 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  100 
 
 		 337 aa  697    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  56.04 
 
 		 341 aa  383  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  55.15 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  53.87 
 
 		 343 aa  360  2e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  51.23 
 
 		 334 aa  328  6e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  44.41 
 
 		 353 aa  301  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  44.81 
 
 		 348 aa  290  2e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  42.42 
 
 		 353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  39.88 
 
 		 344 aa  250  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  40.12 
 
 		 346 aa  247  3e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  40.06 
 
 		 343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  40.48 
 
 		 332 aa  245  9e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3338  Radical SAM domain protein  41.21 
 
 		 331 aa  242  7.999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1383  Radical SAM domain protein  39.39 
 
 		 331 aa  229  6e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632636  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  36.66 
 
 		 371 aa  212  9e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  36.58 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  36.15 
 
 		 371 aa  209  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  35.28 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  35.65 
 
 		 380 aa  191  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  37.23 
 
 		 350 aa  187  3e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  31.8 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  34.33 
 
 		 300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0768  radical SAM domain-containing protein  32.89 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00853946 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1414  radical SAM domain-containing protein  34.43 
 
 		 290 aa  162  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1901  radical SAM domain-containing protein  34.34 
 
 		 298 aa  159  7e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.844314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  35.11 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  29.29 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  28.26 
 
 		 409 aa  96.3  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  27.05 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  24.82 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  26.58 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  25.64 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  21.53 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  27.14 
 
 		 417 aa  49.7  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1357  pyruvate formate-lyase activating enzyme  28.08 
 
 		 235 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1170  pyruvate formate-lyase activating enzyme  28.08 
 
 		 235 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.763287  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  24.84 
 
 		 345 aa  43.1  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>