158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5088 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5088  methyltransferase type 12  100 
 
 
348 aa  717    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1267  methyltransferase type 12  78.74 
 
 
350 aa  587  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12451  hypothetical protein  57.31 
 
 
348 aa  422  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.741785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3450  methyltransferase type 12  33.62 
 
 
356 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  28.7 
 
 
259 aa  60.1  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
220 aa  56.2  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  34.58 
 
 
252 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 
202 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  34.72 
 
 
265 aa  54.7  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0911  Methyltransferase type 11  23.23 
 
 
247 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  30.2 
 
 
575 aa  52.8  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.89 
 
 
259 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  28.19 
 
 
208 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  28.3 
 
 
211 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 
250 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  26.98 
 
 
277 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4547  methyltransferase type 11  34.91 
 
 
254 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577153  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0030  methyltransferase type 12  29.52 
 
 
368 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07800  methyltransferase family protein  33.57 
 
 
261 aa  50.4  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 
250 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  34.15 
 
 
262 aa  50.1  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
258 aa  50.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  21.97 
 
 
201 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  32.08 
 
 
185 aa  49.7  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6712  methyltransferase type 12  30.25 
 
 
237 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  32.86 
 
 
198 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  32.86 
 
 
198 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  23.85 
 
 
248 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  30.7 
 
 
248 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  31.43 
 
 
198 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  32.86 
 
 
198 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2254  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.04 
 
 
417 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.249887  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  37.74 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  20.69 
 
 
277 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  30.83 
 
 
198 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  31.53 
 
 
246 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  29.38 
 
 
198 aa  47.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  28.79 
 
 
195 aa  47.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  21.97 
 
 
199 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
246 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  27.69 
 
 
236 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
202 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  21.02 
 
 
250 aa  47.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
675 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09370  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  30.82 
 
 
256 aa  47.4  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.963324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  34.26 
 
 
247 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  30 
 
 
211 aa  47  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  25.66 
 
 
261 aa  47  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3485  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
246 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  36.28 
 
 
208 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  29.84 
 
 
262 aa  46.6  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1608  tellurite resistance protein TehB  32.56 
 
 
197 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
199 aa  46.6  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  22.73 
 
 
200 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  22.73 
 
 
200 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 
241 aa  46.6  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  31.69 
 
 
410 aa  46.6  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  29.73 
 
 
249 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  34.82 
 
 
560 aa  46.2  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
281 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1553  tellurite resistance protein TehB  32.14 
 
 
198 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2485  hypothetical protein  28 
 
 
252 aa  46.2  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  34 
 
 
276 aa  46.2  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  27.27 
 
 
249 aa  46.2  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  27.78 
 
 
541 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2217  tellurite resistance protein TehB  31.78 
 
 
197 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1763  hypothetical protein  48.84 
 
 
109 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.013046  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  27.68 
 
 
208 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2559  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.68 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  29.55 
 
 
198 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
211 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  31.47 
 
 
223 aa  45.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  22.9 
 
 
200 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  28.86 
 
 
201 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  35.11 
 
 
214 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 
216 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  27.48 
 
 
209 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  29 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2035  tellurite resistance protein TehB  31.54 
 
 
197 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211796  hitchhiker  1.4996099999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
288 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  33.1 
 
 
196 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3184  methyltransferase small  38.18 
 
 
244 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241453  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  31.45 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  29.77 
 
 
267 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  33.01 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.62 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.12 
 
 
234 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  33.01 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  33.01 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1745  tellurite resistance protein TehB  31.78 
 
 
197 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000325665  hitchhiker  3.84687e-20 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  37.31 
 
 
208 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  27.78 
 
 
541 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01387  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.58 
 
 
197 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  27.14 
 
 
262 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1780  methyltransferase type 11  55.81 
 
 
198 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0020102  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  24.83 
 
 
236 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  37.93 
 
 
319 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 
276 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>