More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3394 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  53.6 
 
 		 619 aa  637    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3396  acyl-CoA synthetase  59.97 
 
 		 592 aa  720    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.733588  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3394  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 577 aa  1168    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.682932  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  87.3 
 
 		 576 aa  1042    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3129  acyl-CoA synthetase  60.3 
 
 		 592 aa  724    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.853236  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12944  acyl-CoA synthetase  55.65 
 
 		 626 aa  663    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12955  acyl-CoA synthetase  53.82 
 
 		 580 aa  628  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11554  acyl-CoA synthetase  52.14 
 
 		 583 aa  621  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2836  acyl-CoA synthetase  55.25 
 
 		 580 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2867  acyl-CoA synthetase  55.44 
 
 		 580 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.70026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2880  acyl-CoA synthetase  55.25 
 
 		 631 aa  621  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.894395  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11562  acyl-CoA synthetase  52.4 
 
 		 584 aa  617  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3104  acyl-CoA synthetase  51.21 
 
 		 601 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3164  acyl-CoA synthetase  51.21 
 
 		 601 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal  0.383191 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3124  acyl-CoA synthetase  51.21 
 
 		 601 aa  605  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11209  acyl-CoA synthetase  50.87 
 
 		 578 aa  597  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0272  acyl-CoA synthetase  51.66 
 
 		 573 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984727  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13860  acyl-CoA synthetase  51.39 
 
 		 584 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0402  acyl-CoA synthetase  52.26 
 
 		 573 aa  579  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795318  normal  0.658379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0237  acyl-CoA synthetase  50.17 
 
 		 590 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0247  acyl-CoA synthetase  49.83 
 
 		 590 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0257  acyl-CoA synthetase  49.83 
 
 		 590 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10409  acyl-CoA synthetase  45.78 
 
 		 585 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  42.83 
 
 		 597 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  43.59 
 
 		 574 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3604  putative fatty-acid--CoA ligase  41.54 
 
 		 593 aa  415  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.698537  normal  0.297666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2901  putative fatty-acid--CoA ligase  42.32 
 
 		 593 aa  391  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.650918  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  39.05 
 
 		 640 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.541656  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11954  putative fatty-acid--CoA ligase  41.38 
 
 		 620 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.607108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13835  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.82 
 
 		 637 aa  368  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331415  normal  0.284181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0174  AMP-dependent synthetase and ligase  38.23 
 
 		 636 aa  365  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121627  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.72 
 
 		 629 aa  360  4e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.21 
 
 		 629 aa  354  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  38.28 
 
 		 599 aa  351  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  36 
 
 		 608 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3855  putative fatty-acid--CoA ligase  40.25 
 
 		 605 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724696  hitchhiker  0.00746256 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  34.53 
 
 		 611 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  37.69 
 
 		 578 aa  347  5e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3869  putative fatty-acid--CoA ligase  39.15 
 
 		 605 aa  347  5e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3943  putative fatty-acid--CoA ligase  39.15 
 
 		 605 aa  347  5e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.082676  normal  0.0172927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.04 
 
 		 629 aa  346  6e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.04 
 
 		 629 aa  346  6e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.04 
 
 		 629 aa  345  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  36.48 
 
 		 1656 aa  343  5e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  36.46 
 
 		 579 aa  342  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 		 725 aa  339  7e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 		 725 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  38.9 
 
 		 2721 aa  333  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  37.11 
 
 		 4317 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  37.11 
 
 		 4317 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  34.32 
 
 		 1067 aa  332  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  33.51 
 
 		 2997 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  35.64 
 
 		 1474 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  36.97 
 
 		 4332 aa  331  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  37.02 
 
 		 4317 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  36.88 
 
 		 1801 aa  330  6e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  32.99 
 
 		 581 aa  326  6e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  36.72 
 
 		 4317 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  37.04 
 
 		 4336 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  33.16 
 
 		 581 aa  325  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 582 aa  325  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2966  putative fatty-acid--CoA ligase  38.39 
 
 		 607 aa  325  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.453521  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  36.03 
 
 		 586 aa  322  9.000000000000001e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  37.34 
 
 		 2791 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  33.68 
 
 		 2762 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  37.63 
 
 		 609 aa  319  7e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  37.24 
 
 		 4318 aa  318  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  36.68 
 
 		 2103 aa  318  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  36.43 
 
 		 4336 aa  317  5e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 		 596 aa  316  6e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  35.04 
 
 		 592 aa  313  5.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  35.29 
 
 		 2820 aa  312  9e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 		 614 aa  312  9e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  33.81 
 
 		 991 aa  312  9e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  36.11 
 
 		 3235 aa  312  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1754  acyl-CoA synthetase  31.73 
 
 		 564 aa  311  2e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0433  AMP-binding enzyme family protein  31.73 
 
 		 559 aa  311  2.9999999999999997e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2943  Acyl-CoA synthetases  34.97 
 
 		 617 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  35.86 
 
 		 2250 aa  309  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1161  saframycin Mx1 synthetase B  34.63 
 
 		 617 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  34.63 
 
 		 617 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  37.13 
 
 		 4342 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  33.11 
 
 		 597 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  33.11 
 
 		 597 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  37.1 
 
 		 6403 aa  306  6e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  34.39 
 
 		 588 aa  306  7e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  36.38 
 
 		 4342 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18360  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.84 
 
 		 577 aa  303  6.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  34.52 
 
 		 3231 aa  302  9e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0276  AMP-binding domain-containing protein  34.68 
 
 		 620 aa  302  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  35.47 
 
 		 706 aa  301  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  35.77 
 
 		 1699 aa  300  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 		 602 aa  299  7e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  34.84 
 
 		 755 aa  297  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 595 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  34.85 
 
 		 4268 aa  296  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 		 593 aa  295  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  33.45 
 
 		 1753 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 		 1272 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  35.69 
 
 		 1789 aa  293  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>