162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1716 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  97.83 
 
 		 323 aa  648    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 323 aa  659    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  95.36 
 
 		 323 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  37.65 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  36.88 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  37.22 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  37.07 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  37.66 
 
 		 327 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  35.51 
 
 		 321 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  34.92 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  34.73 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  34.41 
 
 		 320 aa  172  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  34.29 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  33.76 
 
 		 318 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  33.44 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  32.7 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  33.12 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  33.65 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  35.17 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  30.3 
 
 		 350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  33.55 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  33.54 
 
 		 335 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  32.7 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  31.94 
 
 		 318 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  37.07 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  34.26 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  32.63 
 
 		 345 aa  142  9e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  32.49 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  35.14 
 
 		 309 aa  139  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  33.94 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  36.13 
 
 		 319 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  33.75 
 
 		 329 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  33.97 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888679 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  31.07 
 
 		 335 aa  133  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  33.54 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  31.11 
 
 		 320 aa  133  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  33.45 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  32.18 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  32.99 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  31.96 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  31.89 
 
 		 343 aa  125  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3600  2OG-Fe(II) oxygenase  34.12 
 
 		 317 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3673  2OG-Fe(II) oxygenase  34.12 
 
 		 317 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3605  2OG-Fe(II) oxygenase  34.12 
 
 		 317 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  35.31 
 
 		 339 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  31.01 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  32.28 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  31.97 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  31.97 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  31.13 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  33.44 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  29.91 
 
 		 341 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  36.58 
 
 		 346 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  31.56 
 
 		 346 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  31.56 
 
 		 346 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  31.56 
 
 		 346 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  29.41 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  31.52 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  33.22 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  32.51 
 
 		 332 aa  113  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  32.12 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  32.71 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  33.91 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  34.66 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  31.56 
 
 		 350 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45605  predicted protein  26.14 
 
 		 337 aa  105  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147152  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  31.67 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  33.67 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  30.63 
 
 		 344 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  32.27 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  32.2 
 
 		 349 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  32.4 
 
 		 355 aa  102  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  29.8 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01711  Iron/ascorbate oxidoreductase  28.3 
 
 		 317 aa  99  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.745381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  29.72 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  29.72 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  28.27 
 
 		 564 aa  97.1  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  32.38 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  31.09 
 
 		 367 aa  96.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  29.72 
 
 		 343 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  31.15 
 
 		 355 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  31.15 
 
 		 355 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  26.51 
 
 		 327 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4256  2OG-Fe(II) oxygenase  29.2 
 
 		 406 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  28.45 
 
 		 340 aa  92.8  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31468  predicted protein  26.43 
 
 		 341 aa  90.5  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  32.22 
 
 		 347 aa  89.7  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  28.78 
 
 		 326 aa  89.4  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  28.74 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  32.84 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  32.84 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  27.61 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  28.07 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  23.46 
 
 		 328 aa  85.9  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  31.39 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2436  2OG-Fe(II) oxygenase  28.9 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.995426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  28.9 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1753  2OG-Fe(II) oxygenase  29.32 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>