27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0092 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
388 aa  745    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  39.58 
 
 
428 aa  222  9e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0769  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3435  major facilitator transporter  35.29 
 
 
435 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4313  major facilitator transporter  29.62 
 
 
407 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458904  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4421  major facilitator transporter  28.32 
 
 
434 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0230065  normal  0.999715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2780  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  22.13 
 
 
432 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20110  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 
447 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3333  major facilitator transporter  28.84 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.230737 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  25.45 
 
 
399 aa  61.2  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47374  predicted protein  24.51 
 
 
557 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0309  major facilitator transporter  22.69 
 
 
389 aa  54.3  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0224718  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1531  major facilitator transporter  34.55 
 
 
405 aa  53.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  27.59 
 
 
377 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1639  major facilitator transporter  36.05 
 
 
390 aa  49.7  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.410094  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6018  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 
420 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
438 aa  49.7  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46289  predicted protein  26.01 
 
 
439 aa  47.4  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.862046  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1609  major facilitator transporter  25.33 
 
 
410 aa  47  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.655483 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  24.71 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0899  major facilitator transporter  31.68 
 
 
413 aa  44.3  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2103  major facilitator transporter  30.1 
 
 
422 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941752  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1067  major facilitator transporter  21.88 
 
 
396 aa  43.9  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0925  major facilitator transporter  23.6 
 
 
400 aa  43.9  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  26.81 
 
 
407 aa  43.5  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>