15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1639 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1639  major facilitator transporter  100 
 
 		 390 aa  742    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.410094  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0889  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2910  transport protein  25.12 
 
 		 432 aa  96.7  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464136  decreased coverage  0.0000430598 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1143  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 399 aa  90.1  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.41427 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0437  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0249  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1249  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000314091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20110  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0092  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 438 aa  54.7  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0736  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00989309 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0556  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.968297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4421  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 434 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0230065  normal  0.999715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1531  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>