More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1876 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1876  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
416 aa  830    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.963985  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2149  histidinol dehydrogenase  71.81 
 
 
426 aa  629  1e-179  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547932  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2206  histidinol dehydrogenase  70.6 
 
 
416 aa  608  1e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  63.44 
 
 
442 aa  548  1e-155  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  67.58 
 
 
403 aa  550  1e-155  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  54.52 
 
 
426 aa  451  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  55.2 
 
 
426 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  49.88 
 
 
433 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0791  histidinol dehydrogenase  47.57 
 
 
424 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.139873  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1687  histidinol dehydrogenase  47.09 
 
 
424 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0863  histidinol dehydrogenase  46.67 
 
 
426 aa  370  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.998875  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0213  histidinol dehydrogenase  47.33 
 
 
424 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.314414 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0291  histidinol dehydrogenase  45.65 
 
 
425 aa  362  9e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0634762  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  49.62 
 
 
457 aa  357  2.9999999999999997e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0023  histidinol dehydrogenase  50.99 
 
 
435 aa  355  6.999999999999999e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  47.69 
 
 
430 aa  354  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  44.5 
 
 
424 aa  352  7e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  46.4 
 
 
429 aa  351  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  45.77 
 
 
429 aa  351  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  46.12 
 
 
436 aa  350  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  46.72 
 
 
430 aa  349  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  50 
 
 
439 aa  348  9e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  47.19 
 
 
429 aa  347  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  43.4 
 
 
430 aa  347  3e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1869  histidinol dehydrogenase  49.63 
 
 
432 aa  346  4e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  44.3 
 
 
427 aa  346  5e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  43.94 
 
 
434 aa  344  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  44.33 
 
 
436 aa  344  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  46.45 
 
 
429 aa  342  9e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2478  histidinol dehydrogenase  48.52 
 
 
425 aa  340  2e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  44.9 
 
 
431 aa  341  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  45.86 
 
 
454 aa  340  4e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2429  histidinol dehydrogenase  43.97 
 
 
443 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2526  histidinol dehydrogenase  43.97 
 
 
443 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  45.8 
 
 
427 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  46.98 
 
 
434 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3170  histidinol dehydrogenase  43.97 
 
 
443 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  45.2 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  42.45 
 
 
431 aa  336  5e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  46.25 
 
 
436 aa  335  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  47.47 
 
 
432 aa  335  9e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  44.99 
 
 
428 aa  334  1e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  44.36 
 
 
429 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  42.34 
 
 
432 aa  333  3e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1141  histidinol dehydrogenase  45.06 
 
 
422 aa  332  7.000000000000001e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.517537  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  46.63 
 
 
431 aa  332  9e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  47.97 
 
 
424 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  43.61 
 
 
429 aa  332  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  43.86 
 
 
429 aa  330  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2330  histidinol dehydrogenase  44.22 
 
 
436 aa  330  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0874985  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  43.61 
 
 
429 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  44.11 
 
 
429 aa  330  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  43.89 
 
 
428 aa  330  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  45.07 
 
 
435 aa  330  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  46.19 
 
 
446 aa  330  3e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  44.53 
 
 
437 aa  330  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  43.86 
 
 
429 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  46.83 
 
 
430 aa  329  7e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1963  histidinol dehydrogenase  45.04 
 
 
436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318488  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  46.45 
 
 
435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  45.94 
 
 
433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1818  histidinol dehydrogenase  43.81 
 
 
429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1942  histidinol dehydrogenase  43.86 
 
 
435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  46.83 
 
 
430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  43.8 
 
 
427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0450  histidinol dehydrogenase  46.53 
 
 
424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.722983  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  43.1 
 
 
430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  43.36 
 
 
429 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0801  histidinol dehydrogenase  44.72 
 
 
427 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  47.54 
 
 
436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  43.61 
 
 
429 aa  326  5e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  43.61 
 
 
429 aa  326  5e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  42.64 
 
 
429 aa  326  6e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1784  histidinol dehydrogenase  43.61 
 
 
429 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112475  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  44.77 
 
 
424 aa  324  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  46.68 
 
 
445 aa  324  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  45.89 
 
 
430 aa  324  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1289  histidinol dehydrogenase  43.69 
 
 
428 aa  324  2e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  42.86 
 
 
426 aa  324  2e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  45.68 
 
 
422 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0849  histidinol dehydrogenase  44.2 
 
 
428 aa  324  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1617  histidinol dehydrogenase  43.04 
 
 
438 aa  323  4e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0248  histidinol dehydrogenase  42.34 
 
 
432 aa  323  5e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0445362  normal  0.0626042 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2450  histidinol dehydrogenase  49.26 
 
 
424 aa  322  6e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.212044  normal  0.13889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  46.72 
 
 
433 aa  322  8e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01117  Histidinol dehydrogenase  42.54 
 
 
434 aa  321  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1898  Histidinol dehydrogenase  43.54 
 
 
428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0973  histidinol dehydrogenase  44.28 
 
 
441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.56218  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  43.2 
 
 
426 aa  319  5e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0884  histidinol dehydrogenase  45.02 
 
 
436 aa  319  6e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.461967  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2778  histidinol dehydrogenase  43.36 
 
 
433 aa  319  7e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  45.71 
 
 
441 aa  319  7e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  43 
 
 
428 aa  318  1e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  45.61 
 
 
431 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12930  histidinol dehydrogenase  44.19 
 
 
436 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  43.78 
 
 
425 aa  318  1e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1005  histidinol dehydrogenase  44.03 
 
 
441 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.866219  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0966  histidinol dehydrogenase  44.53 
 
 
441 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1861  histidinol dehydrogenase  41.75 
 
 
428 aa  316  4e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2198  histidinol dehydrogenase  40.85 
 
 
443 aa  316  5e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0308106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>