More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2393 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2393  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 214 aa  442  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000018478  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1423  30S ribosomal protein S2  71.77 
 
 		 247 aa  320  8e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.017125 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0478  30S ribosomal protein S2  71.96 
 
 		 206 aa  295  3e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2599  30S ribosomal protein S2  62.56 
 
 		 259 aa  274  6e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2514  30S ribosomal protein S2  61.22 
 
 		 267 aa  274  6e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0430  ribosomal protein S2  61.54 
 
 		 263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.748529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2544  ribosomal protein S2  60.51 
 
 		 269 aa  270  9e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2215  30S ribosomal protein S2  65.24 
 
 		 203 aa  268  2.9999999999999997e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1810  30S ribosomal protein S2  64.06 
 
 		 205 aa  267  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2378  30S ribosomal protein S2  61.9 
 
 		 202 aa  263  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00361654  normal  0.260163 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1826  30S ribosomal protein S2  60.32 
 
 		 268 aa  261  6e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1237  30S ribosomal protein S2  62.57 
 
 		 202 aa  256  1e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.161578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2892  30S ribosomal protein S2  63.1 
 
 		 202 aa  234  9e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00129354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1302  ribosomal protein S2  55.9 
 
 		 199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.29354  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0759  30S ribosomal protein S2  53.23 
 
 		 220 aa  222  3e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.817066  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0907  30S ribosomal protein S2  51.08 
 
 		 220 aa  216  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1524  30S ribosomal protein S2  50 
 
 		 221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.524219  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0219  30S ribosomal protein S2  50.54 
 
 		 221 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.664063  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1693  30S ribosomal protein S2  50.54 
 
 		 221 aa  214  7e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2140  30S ribosomal protein S2  48 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000050996  hitchhiker  0.0000667505 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0274  30S ribosomal protein S2  52.31 
 
 		 214 aa  211  7e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1047  ribosomal protein S2  52.06 
 
 		 226 aa  208  4e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.269348  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1104  30S ribosomal protein S2  45.63 
 
 		 207 aa  188  5e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0027  30S ribosomal protein S2  45.15 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0058  30S ribosomal protein S2  46.46 
 
 		 206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0190126 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0061  30S ribosomal protein S2  43.69 
 
 		 208 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.924609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0316  30S ribosomal protein S2  42.08 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2002  30S ribosomal protein S2  41.62 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03172  40S ribosomal protein S0 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F8]  44.13 
 
 		 293 aa  159  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13682  predicted protein  40.12 
 
 		 220 aa  149  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04340  40S ribosomal protein S0, putative  42.26 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.220661  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76999  ribosomal protein S0A  41.18 
 
 		 261 aa  141  8e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.937942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12355  Ribosomal protein Sa, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  37.5 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.30496  normal  0.113443 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  26.22 
 
 		 324 aa  71.2  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  25.52 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  26.15 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  26.36 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  23.47 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  23.2 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  23.2 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  22.94 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  26.76 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  23 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  23.94 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  23.47 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  24.41 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0377  30S ribosomal protein S2  24.43 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1548  30S ribosomal protein S2  26.39 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.403357 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  24.31 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  23.85 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  24 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  24.31 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  24.44 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  23.11 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  23.47 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1398  SSU ribosomal protein S2P  25.81 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000184086  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  26.89 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  25.35 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  25.22 
 
 		 257 aa  62  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  25.21 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1510  30S ribosomal protein S2  24.77 
 
 		 274 aa  62  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.0221668 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_321  ribosomal protein S2  24.77 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000206427  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  23 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  24.31 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2860  30S ribosomal protein S2  25.23 
 
 		 253 aa  61.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2306  30S ribosomal protein S2  25.35 
 
 		 276 aa  61.6  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1433  30S ribosomal protein S2  25.23 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086997 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1780  30S ribosomal protein S2  25.94 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000158872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2680  30S ribosomal protein S2  23.26 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000034456  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  24.88 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  23.98 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_002936  DET0377  30S ribosomal protein S2  24.3 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  23.94 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0371  30S ribosomal protein S2  23.11 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0359  30S ribosomal protein S2  24.3 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0026  30S ribosomal protein S2  42.25 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  23.47 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  24.2 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  23.94 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  23 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  25.35 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  23.47 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  24.65 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  24.65 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  23 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  22.18 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  23.94 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1285  ribosomal protein S2  25.23 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297191  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  23 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  22.67 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  25 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  23.94 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  25 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  22.87 
 
 		 260 aa  57  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2976  ribosomal protein S2  23.73 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  24.19 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  24.19 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  24.19 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  24.19 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  23.47 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>