More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1363 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  56.79 
 
 		 612 aa  706    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 610 aa  1202    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  36.5 
 
 		 630 aa  384  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  37.17 
 
 		 617 aa  377  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  38.63 
 
 		 626 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  37.13 
 
 		 617 aa  368  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  37.38 
 
 		 628 aa  361  2e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  39.43 
 
 		 620 aa  345  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  35.48 
 
 		 652 aa  283  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  35.48 
 
 		 652 aa  283  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  35.38 
 
 		 641 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  33.87 
 
 		 640 aa  274  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  33.61 
 
 		 629 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  30.91 
 
 		 599 aa  251  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  32.48 
 
 		 637 aa  251  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  37.33 
 
 		 764 aa  248  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  31.12 
 
 		 598 aa  246  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  37.18 
 
 		 763 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  31.49 
 
 		 639 aa  244  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  30.55 
 
 		 597 aa  244  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  32.7 
 
 		 628 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  34.25 
 
 		 760 aa  238  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  34.1 
 
 		 622 aa  234  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  30.74 
 
 		 601 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  33.26 
 
 		 607 aa  225  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  30.33 
 
 		 601 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  29.92 
 
 		 601 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  31.6 
 
 		 611 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  35.09 
 
 		 852 aa  220  7.999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  29.11 
 
 		 606 aa  219  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  30.77 
 
 		 602 aa  219  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  32.95 
 
 		 599 aa  218  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  28.99 
 
 		 608 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  31.19 
 
 		 741 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  32.02 
 
 		 660 aa  214  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  31.91 
 
 		 637 aa  212  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  30.04 
 
 		 625 aa  212  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  33.11 
 
 		 616 aa  212  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  30.9 
 
 		 617 aa  211  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  32 
 
 		 651 aa  211  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  30.66 
 
 		 604 aa  210  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.7 
 
 		 666 aa  209  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.58 
 
 		 596 aa  209  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  32.13 
 
 		 619 aa  209  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  32.19 
 
 		 670 aa  209  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  34.91 
 
 		 616 aa  209  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  26.65 
 
 		 596 aa  208  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  29.26 
 
 		 602 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.38 
 
 		 596 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  27.38 
 
 		 596 aa  207  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.38 
 
 		 596 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.38 
 
 		 596 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.96 
 
 		 669 aa  207  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.38 
 
 		 596 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  31.72 
 
 		 670 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  31.72 
 
 		 673 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  29.55 
 
 		 569 aa  204  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  30.25 
 
 		 611 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  30.25 
 
 		 611 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  30.17 
 
 		 623 aa  203  9e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  36.57 
 
 		 593 aa  200  7e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  31.66 
 
 		 643 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  30.51 
 
 		 625 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  34.07 
 
 		 719 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  32.72 
 
 		 660 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  32.72 
 
 		 660 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  32.72 
 
 		 660 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  32.72 
 
 		 660 aa  190  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  29.34 
 
 		 607 aa  188  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  34.84 
 
 		 421 aa  188  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  31.3 
 
 		 702 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.02 
 
 		 399 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.45 
 
 		 399 aa  177  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  29.27 
 
 		 609 aa  173  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  34.46 
 
 		 414 aa  172  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.84 
 
 		 401 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  33.43 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  33.43 
 
 		 414 aa  169  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.84 
 
 		 401 aa  168  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  33.43 
 
 		 402 aa  167  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  26.92 
 
 		 595 aa  166  9e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.48 
 
 		 421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  29.7 
 
 		 584 aa  147  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  29.17 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  27.01 
 
 		 498 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  25.7 
 
 		 640 aa  140  7e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  30.13 
 
 		 407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  28.8 
 
 		 414 aa  131  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  27.66 
 
 		 577 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  27.47 
 
 		 577 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  27.47 
 
 		 577 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  27.47 
 
 		 577 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  27.47 
 
 		 577 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  28.61 
 
 		 572 aa  125  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  27.13 
 
 		 581 aa  124  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  27 
 
 		 577 aa  124  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  24.82 
 
 		 597 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  27.13 
 
 		 581 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  26.39 
 
 		 580 aa  120  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  27.53 
 
 		 576 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>