More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2215 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2215  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2378  30S ribosomal protein S2  81.41 
 
 		 202 aa  345  3e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00361654  normal  0.260163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1810  30S ribosomal protein S2  79.7 
 
 		 205 aa  335  1.9999999999999998e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1237  30S ribosomal protein S2  74.87 
 
 		 202 aa  316  2e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.161578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2892  30S ribosomal protein S2  76.38 
 
 		 202 aa  298  4e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00129354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2599  30S ribosomal protein S2  65.08 
 
 		 259 aa  270  8.000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0430  ribosomal protein S2  61.93 
 
 		 263 aa  269  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.748529  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2393  30S ribosomal protein S2  65.24 
 
 		 214 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000018478  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2514  30S ribosomal protein S2  62.96 
 
 		 267 aa  268  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2544  ribosomal protein S2  61.42 
 
 		 269 aa  266  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1826  30S ribosomal protein S2  64.02 
 
 		 268 aa  265  2.9999999999999995e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0478  30S ribosomal protein S2  64.25 
 
 		 206 aa  256  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1423  30S ribosomal protein S2  59.79 
 
 		 247 aa  254  9e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.017125 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1302  ribosomal protein S2  56.85 
 
 		 199 aa  230  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.29354  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0759  30S ribosomal protein S2  54.55 
 
 		 220 aa  220  9e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.817066  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1524  30S ribosomal protein S2  53.98 
 
 		 221 aa  218  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.524219  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1693  30S ribosomal protein S2  50 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0219  30S ribosomal protein S2  51.7 
 
 		 221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.664063  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0907  30S ribosomal protein S2  50.57 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2140  30S ribosomal protein S2  52.27 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000050996  hitchhiker  0.0000667505 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1047  ribosomal protein S2  50.56 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.269348  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0274  30S ribosomal protein S2  49.2 
 
 		 214 aa  197  9e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0058  30S ribosomal protein S2  44.61 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0190126 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1104  30S ribosomal protein S2  44.44 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0027  30S ribosomal protein S2  44.44 
 
 		 208 aa  174  5e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0061  30S ribosomal protein S2  43.41 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.924609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0316  30S ribosomal protein S2  43.33 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2002  30S ribosomal protein S2  41.36 
 
 		 215 aa  160  8.000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13682  predicted protein  37.88 
 
 		 220 aa  160  9e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03172  40S ribosomal protein S0 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F8]  43.93 
 
 		 293 aa  160  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04340  40S ribosomal protein S0, putative  40.24 
 
 		 292 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.220661  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76999  ribosomal protein S0A  39.55 
 
 		 261 aa  145  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.937942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12355  Ribosomal protein Sa, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  35.96 
 
 		 290 aa  134  8e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.30496  normal  0.113443 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  26.32 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  25.94 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  25.94 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1780  30S ribosomal protein S2  23.95 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000158872  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  25.47 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  28.77 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  28.77 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0371  30S ribosomal protein S2  27.83 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  27.49 
 
 		 256 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  28.17 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  26.54 
 
 		 257 aa  67  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  28.1 
 
 		 301 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2306  30S ribosomal protein S2  26.84 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  27.01 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  24.88 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  25.94 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1510  30S ribosomal protein S2  26.64 
 
 		 274 aa  64.7  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.0221668 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  29.22 
 
 		 251 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  27.4 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  25.47 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  24.28 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1433  30S ribosomal protein S2  27.35 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086997 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2860  30S ribosomal protein S2  26.75 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  24.53 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  24.53 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  25.45 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  25.45 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  24.15 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  24.06 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  24.06 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0377  30S ribosomal protein S2  24.88 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0359  30S ribosomal protein S2  24.41 
 
 		 245 aa  62  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  24.06 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1004  ribosomal protein S2  24.41 
 
 		 283 aa  61.6  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.663705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  23.73 
 
 		 280 aa  61.6  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  24.06 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2019  30S ribosomal protein S2  23.94 
 
 		 262 aa  61.2  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_002950  PG0377  30S ribosomal protein S2  23.7 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  26.73 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  24.14 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1484  ribosomal protein S2  25.11 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068355  normal  0.329281 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  26.73 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3410  ribosomal protein S2  25.45 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.7242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1398  SSU ribosomal protein S2P  25.45 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000184086  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  26.64 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_321  ribosomal protein S2  24.41 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000206427  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0213  ribosomal protein S2  23.45 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  24.17 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2733  ribosomal protein S2  23.65 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36757e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  27.04 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08130  SSU ribosomal protein S2P  23.45 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000058431  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  23.58 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  25 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  23.58 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  25.47 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3726  30S ribosomal protein S2  26.32 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_002620  TC0051  30S ribosomal protein S2  26.44 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0293672  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0994  30S ribosomal protein S2  25 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271344  normal  0.423917 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  23.58 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  23.28 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4961  30S ribosomal protein S2  24.53 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  24.06 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  24.06 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  24.06 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  24.06 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  24.06 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  24.06 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>