More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3057 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  100 
 
 		 157 aa  325  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.28 
 
 		 160 aa  199  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  57.33 
 
 		 150 aa  190  5e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  54.43 
 
 		 158 aa  186  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.9 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  55.33 
 
 		 163 aa  176  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  50 
 
 		 159 aa  174  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  50 
 
 		 159 aa  174  5e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  52 
 
 		 155 aa  174  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.33 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.66 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.33 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.99 
 
 		 157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.34 
 
 		 163 aa  158  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  49.36 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  48.34 
 
 		 154 aa  154  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.5 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  49.02 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.5 
 
 		 161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  47.37 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.33 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.67 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  46.9 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  43.31 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.95 
 
 		 164 aa  137  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.67 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  42.95 
 
 		 155 aa  133  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  43.62 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  42.86 
 
 		 186 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.4 
 
 		 164 aa  130  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  39.6 
 
 		 151 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.97 
 
 		 223 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.21 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  43.66 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  41.04 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  47.92 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  40.69 
 
 		 151 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.24 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  39.62 
 
 		 176 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.74 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  34.97 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.75 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  42 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  41.83 
 
 		 154 aa  121  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  41.83 
 
 		 154 aa  121  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.61 
 
 		 188 aa  120  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.26 
 
 		 153 aa  120  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.78 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.13 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.96 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.67 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  42.21 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.66 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42 
 
 		 161 aa  114  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2436  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 		 301 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.89 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  42.86 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.52 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  41.8 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  43.22 
 
 		 163 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.07 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04155  putative cytosine/adenosine deaminase  45.79 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411988  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.87 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  43.88 
 
 		 182 aa  99  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1655  guanine deaminase  36.09 
 
 		 298 aa  98.6  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.06 
 
 		 141 aa  98.2  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  41.8 
 
 		 193 aa  98.2  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  47.5 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  40.35 
 
 		 147 aa  97.4  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46 
 
 		 161 aa  95.5  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  42.86 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3970  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.08 
 
 		 176 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2118  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.46 
 
 		 174 aa  95.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  44 
 
 		 168 aa  95.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2500  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.67 
 
 		 190 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.59246 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.74 
 
 		 484 aa  94.4  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.57 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.57 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  42.06 
 
 		 143 aa  93.6  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.45 
 
 		 176 aa  92.8  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.24 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2842  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  37.82 
 
 		 194 aa  92.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  44.64 
 
 		 177 aa  92  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.6 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3440  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.44 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  41 
 
 		 151 aa  91.7  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.75 
 
 		 169 aa  91.7  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.75 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  37.32 
 
 		 171 aa  90.9  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.83 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  35.46 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  90.5  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.32 
 
 		 166 aa  90.1  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.11 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1525  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.55 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  41.82 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>