More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3401 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3401  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 
141 aa  293  7e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03070  methionine sulfoxide reductase B  64.18 
 
 
154 aa  190  7e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0440  methionine sulfoxide reductase B  66.41 
 
 
155 aa  189  9e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2001  methionine sulfoxide reductase B  62.31 
 
 
201 aa  179  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0768208  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2558  methionine-R-sulfoxide reductase  59.57 
 
 
141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0971304  normal  0.867883 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2945  methionine-R-sulfoxide reductase  59.57 
 
 
141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1925  methionine sulfoxide reductase B  62.31 
 
 
155 aa  177  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0476823  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3166  methionine sulfoxide reductase B  56.83 
 
 
163 aa  167  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1884  methionine sulfoxide reductase B  59.02 
 
 
137 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000227022  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01747  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 
137 aa  158  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0193587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1864  methionine-R-sulfoxide reductase  56.35 
 
 
137 aa  158  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000480706  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1413  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 
137 aa  158  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2002  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 
137 aa  158  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00962024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2502  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 
137 aa  158  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1863  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 
137 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000150257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01735  hypothetical protein  56.35 
 
 
137 aa  158  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1854  methionine sulfoxide reductase B  56.35 
 
 
137 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0487085  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  56.59 
 
 
136 aa  157  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1402  methionine sulfoxide reductase B  59.02 
 
 
137 aa  157  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.0051199 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2065  methionine sulfoxide reductase B  59.02 
 
 
137 aa  157  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.717826  hitchhiker  0.00120288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1418  methionine sulfoxide reductase B  59.02 
 
 
137 aa  157  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.445758 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1385  methionine sulfoxide reductase B  59.02 
 
 
137 aa  157  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0497198  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  59.83 
 
 
137 aa  157  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  53.79 
 
 
131 aa  155  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  58.2 
 
 
136 aa  153  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1986  methionine sulfoxide reductase B  60.87 
 
 
137 aa  153  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000131447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2095  methionine sulfoxide reductase B  60.87 
 
 
137 aa  153  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000449437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2350  methionine sulfoxide reductase B  60.87 
 
 
137 aa  153  9e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167897  normal  0.0377518 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  57.98 
 
 
166 aa  152  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2727  methionine sulfoxide reductase B  56.78 
 
 
137 aa  152  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00340114  hitchhiker  0.000973633 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  58.54 
 
 
140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  56.91 
 
 
142 aa  150  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2262  methionine sulfoxide reductase B  61.95 
 
 
139 aa  149  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00190122  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1966  methionine sulfoxide reductase B  61.06 
 
 
139 aa  149  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0169175  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  53.54 
 
 
141 aa  148  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  58.97 
 
 
140 aa  147  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  54.14 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1850  methionine sulfoxide reductase B  57.52 
 
 
134 aa  145  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  54.62 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  51.54 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  50.36 
 
 
151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  50.39 
 
 
142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1584  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 
147 aa  144  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000628294  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  50.74 
 
 
148 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  50.37 
 
 
136 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  57.52 
 
 
131 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  55.93 
 
 
132 aa  143  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  55.93 
 
 
132 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  49.23 
 
 
134 aa  142  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  52.85 
 
 
132 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  54.78 
 
 
137 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  53.33 
 
 
174 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  53.66 
 
 
137 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  55.75 
 
 
142 aa  141  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2214  methionine-R-sulfoxide reductase  53.08 
 
 
138 aa  141  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.399657  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  53.49 
 
 
133 aa  141  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  56.91 
 
 
140 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  51.94 
 
 
133 aa  140  5e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  55.08 
 
 
133 aa  140  8e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  51.94 
 
 
167 aa  139  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  51.56 
 
 
127 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  48.85 
 
 
133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  52.89 
 
 
133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  53.85 
 
 
134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  56.52 
 
 
138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  53.04 
 
 
137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  56.1 
 
 
140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1972  methionine-R-sulfoxide reductase  51.85 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  54.4 
 
 
183 aa  138  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  55.28 
 
 
150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  51.56 
 
 
135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  55.75 
 
 
133 aa  137  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  48.84 
 
 
167 aa  136  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  52.99 
 
 
189 aa  136  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
131 aa  135  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  49.61 
 
 
147 aa  135  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  46.03 
 
 
135 aa  135  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  53.33 
 
 
165 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1485  methionine-R-sulfoxide reductase  57.03 
 
 
136 aa  135  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476071  hitchhiker  0.000138534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  50.78 
 
 
167 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  52.8 
 
 
163 aa  135  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0857  PilB-related protein  52.03 
 
 
148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  50.37 
 
 
167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1706  peptide methionine sulfoxide reductase  51.85 
 
 
149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0428865  normal  0.0200729 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  48.82 
 
 
146 aa  134  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  48.78 
 
 
131 aa  134  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  45.32 
 
 
177 aa  134  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  49.61 
 
 
128 aa  133  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  49.61 
 
 
128 aa  133  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  49.62 
 
 
159 aa  133  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
198 aa  133  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  53.78 
 
 
165 aa  133  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  53.98 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  49.61 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  49.6 
 
 
135 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  48.84 
 
 
133 aa  132  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  52.5 
 
 
165 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  52.1 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  51.2 
 
 
138 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  51.2 
 
 
138 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>