174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0629 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0629  UspA domain-containing protein  100 
 
 
271 aa  549  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2103  hypothetical protein  36.53 
 
 
293 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0483069  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2938  universal stress protein  31 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1842  universal stress protein UspE  32.38 
 
 
309 aa  155  8e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000992679  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  31.45 
 
 
310 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2019  universal stress protein UspE  32.38 
 
 
309 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.865134  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1800  universal stress protein UspE  30.07 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.846071  normal  0.320472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2416  universal stress protein UspE  30.28 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268854  decreased coverage  0.000000187412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  30.39 
 
 
310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1986  universal stress protein UspE  33.33 
 
 
316 aa  145  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652994  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2220  universal stress protein UspE  30.68 
 
 
310 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875118  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2161  universal stress protein UspE  31.56 
 
 
310 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2223  universal stress protein UspE  31.56 
 
 
310 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000145957  normal  0.12873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2211  universal stress protein UspE  31.56 
 
 
310 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209938  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4496  universal stress protein UspE  31.56 
 
 
310 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2210  universal stress protein UspE  31.56 
 
 
310 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000689351  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1784  universal stress protein UspE  31.6 
 
 
315 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334213  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1490  universal stress protein UspE  31.6 
 
 
315 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0578551  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1846  universal stress protein UspE  31.6 
 
 
315 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1786  universal stress protein UspE  31.6 
 
 
315 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.144508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1672  universal stress protein UspE  31.6 
 
 
315 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0632813 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1950  universal stress protein UspE  31.91 
 
 
310 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01310  stress-induced protein  30.86 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2312  UspA domain protein  30.86 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.172993  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  30.14 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1449  universal stress protein UspE  30.86 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1980  universal stress protein UspE  30.86 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.420697 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2292  universal stress protein UspE  30.86 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1789  universal stress protein UspE  30.86 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01320  hypothetical protein  30.86 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1915  UspA domain-containing protein  32.09 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1545  universal stress protein UspE  30.86 
 
 
316 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2015  universal stress protein UspE  31.21 
 
 
310 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000455059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  31.21 
 
 
310 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  31.21 
 
 
310 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1863  universal stress protein UspE  32.34 
 
 
319 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.809514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2583  universal stress protein UspE  29.96 
 
 
320 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3216  hypothetical protein  31.62 
 
 
299 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1851  universal stress protein UspE  29 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2734  hypothetical protein  31.62 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1832  universal stress protein UspE  31.85 
 
 
318 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1943  universal stress protein UspE  31.85 
 
 
318 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.361169  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1572  universal stress protein UspE  28.9 
 
 
314 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02064  universal stress protein UspE  30.66 
 
 
307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00593148  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2399  universal stress protein UspE  31.6 
 
 
316 aa  132  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2080  universal stress protein UspE  31.5 
 
 
323 aa  132  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2106  universal stress protein UspE  31.6 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.107549  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02294  universal stress protein UspE  30.47 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3963  hypothetical protein  32.59 
 
 
294 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.144543  normal  0.129841 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0930  universal stress protein UspE  31.82 
 
 
311 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003476  universal stress protein E  30.71 
 
 
254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.181718  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0618  hypothetical protein  32.59 
 
 
294 aa  125  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2065  universal stress protein UspE  31.6 
 
 
311 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1044  universal stress protein UspE  26.98 
 
 
315 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.106711  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0879  universal stress protein UspE  29.43 
 
 
307 aa  123  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0349688  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3514  hypothetical protein  34.86 
 
 
287 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306404  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3393  hypothetical protein  34.29 
 
 
287 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41440  hypothetical protein  33.94 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3432  UspA domain-containing protein  34.58 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.85473  normal  0.743493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2576  UspA domain-containing protein  30.6 
 
 
287 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140838  hitchhiker  0.00089263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0585  hypothetical protein  29.45 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.723189  decreased coverage  0.000113105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2187  universal stress protein  34.58 
 
 
287 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3550  UspA domain-containing protein  34.58 
 
 
287 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3008  UspA domain-containing protein  31.23 
 
 
298 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1811  UspA domain-containing protein  33.64 
 
 
287 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2745  universal stress protein  30.71 
 
 
298 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712229  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38400  universal stress protein family  28.26 
 
 
310 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1258  universal stress protein UspA  31.11 
 
 
320 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3260  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 
302 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3344  hypothetical protein  30.16 
 
 
307 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2095  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 
320 aa  99.4  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3443  hypothetical protein  27.11 
 
 
303 aa  99.4  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2951  universal stress protein UspA  29.02 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.70353  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  28.47 
 
 
310 aa  92.8  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0884  UspA domain-containing protein  25.43 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1041  UspA domain-containing protein  25 
 
 
298 aa  89.7  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3340  universal stress protein  26.6 
 
 
315 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1391  universal stress protein, UspA  32.99 
 
 
327 aa  88.6  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56220  hypothetical protein  28.17 
 
 
304 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25790  universal stress protein, UspA family  27.49 
 
 
311 aa  85.9  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3342  hypothetical protein  26.13 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4897  hypothetical protein  27.68 
 
 
304 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2285  hypothetical protein  30.98 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0988  UspA domain-containing protein  26.05 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3237  universal stress protein  25.09 
 
 
296 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0929  UspA domain protein  26.82 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2623  putative universal stress protein  32.58 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3296  universal stress protein  21.95 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1103  UspA domain-containing protein  23.65 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.384617  normal  0.477468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1169  UspA domain-containing protein  23.65 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0512262  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2169  hypothetical protein  24.38 
 
 
309 aa  77  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.199565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2453  UspA domain-containing protein  24.73 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1066  GGDEF  25.57 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03146  Universal stress protein, UspA  25.45 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.747468  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0722  hypothetical protein  26.29 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.483462 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3347  hypothetical protein  27.92 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1103  hypothetical protein  23.15 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21994  normal  0.105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3031  UspA domain-containing protein  24.47 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1667  universal stress protein family  26.97 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1119  hypothetical protein  30.65 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>