More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0012 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  100 
 
 
220 aa  446  1e-125  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  64.55 
 
 
240 aa  291  5e-78  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  45.12 
 
 
249 aa  191  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  41.59 
 
 
249 aa  184  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  40.55 
 
 
246 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  40.09 
 
 
246 aa  176  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  40.09 
 
 
246 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  40.47 
 
 
246 aa  174  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  39.53 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  39.53 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  39.53 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  39.53 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  39.53 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  44.78 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  39.53 
 
 
246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  39.53 
 
 
246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  37.1 
 
 
243 aa  155  6e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  37.67 
 
 
256 aa  154  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  38.64 
 
 
246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  37.56 
 
 
254 aa  149  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  39.53 
 
 
251 aa  149  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  37.56 
 
 
254 aa  148  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  35.81 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  34.63 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  37.44 
 
 
251 aa  144  8.000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  33.78 
 
 
249 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 
260 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  34.23 
 
 
241 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  35.91 
 
 
249 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  33.95 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  33.95 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  34.09 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  32.72 
 
 
254 aa  131  6e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  32.74 
 
 
263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  34.25 
 
 
248 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  31.22 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  37.5 
 
 
247 aa  125  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  33.8 
 
 
251 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  31.94 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  35.89 
 
 
237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  33.94 
 
 
338 aa  115  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  33.16 
 
 
240 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  31.96 
 
 
245 aa  111  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  31.8 
 
 
255 aa  111  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  31.8 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  29.08 
 
 
211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  30.09 
 
 
256 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  27.35 
 
 
258 aa  101  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  28.18 
 
 
330 aa  100  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  32.67 
 
 
222 aa  98.6  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  25.24 
 
 
268 aa  90.9  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  29.36 
 
 
233 aa  90.1  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  28.57 
 
 
223 aa  87.8  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  26.79 
 
 
266 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  25.36 
 
 
249 aa  84  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0330  O-methyltransferase-like protein  31.34 
 
 
217 aa  84  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  26.77 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  28 
 
 
237 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  25.25 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  23.93 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  27.47 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  24.43 
 
 
243 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  23.76 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  25.41 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  28.18 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  26.54 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  24.88 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  25 
 
 
275 aa  71.6  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  23.04 
 
 
253 aa  71.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  23.04 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  29.07 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  23.21 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  25.14 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  23.87 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  24.52 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  28.17 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  25.27 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  22.77 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  23 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  29.02 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  25.16 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  24.62 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  25.16 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  20.56 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  26.76 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  25.49 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  25.14 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  23.94 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  23.87 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  27.39 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  21.86 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  22.92 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  21.5 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  23.76 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  26.52 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  22.17 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  25.35 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  25.35 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  22.58 
 
 
252 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  25.35 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>