115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0167 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  756    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  73.95 
 
 		 380 aa  591  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  50.52 
 
 		 386 aa  402  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  45.65 
 
 		 366 aa  330  3e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  39.95 
 
 		 381 aa  299  5e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  41.04 
 
 		 382 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  35.94 
 
 		 378 aa  227  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  34.97 
 
 		 378 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  35.43 
 
 		 378 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  34.97 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  34.97 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  34.97 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  34.97 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  34.97 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  35.17 
 
 		 378 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  34.35 
 
 		 378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  33.94 
 
 		 378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  33.33 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  33.86 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  33.86 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  33.68 
 
 		 384 aa  206  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  32.17 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  32.17 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  32.55 
 
 		 380 aa  182  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1398  protein of unknown function DUF214  34.75 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00210458  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  32.37 
 
 		 410 aa  159  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.15 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  31.05 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  29.82 
 
 		 380 aa  150  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  30.16 
 
 		 376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  27.97 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  28.61 
 
 		 407 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  26.65 
 
 		 374 aa  119  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  27.94 
 
 		 376 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  28.01 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  26.25 
 
 		 377 aa  99.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  26.77 
 
 		 385 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  26.17 
 
 		 388 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  24.57 
 
 		 392 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  22.33 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  27.76 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  21.9 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  25.58 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  23.08 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  24.94 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  24.87 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  23.98 
 
 		 384 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  24.47 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0126  hypothetical protein  23.87 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447116  normal  0.743413 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  24.81 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0757  ABC transporter transmembrane protein  22.77 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.750458  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08091  ABC-transporter, membrane spanning component  23.1 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.270503  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  24.09 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  20.72 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  22.83 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  22.51 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  21.5 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  21.13 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  23.06 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  23.8 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  21.52 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  21.41 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0153  ABC transporter transmembrane protein  23.2 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07851  ABC-transporter, membrane spanning component  23.2 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.165508  normal  0.803737 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  24.48 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  22.09 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  21.75 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  19.8 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  24.02 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4323  hypothetical protein  23.26 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  29.78 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.94 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1336  hypothetical protein  29.27 
 
 		 454 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.420659  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  23.64 
 
 		 421 aa  53.5  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  27.88 
 
 		 349 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  23.21 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  25.87 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2783  ABC transporter, membrane spanning subunit, devC-like  26.46 
 
 		 393 aa  50.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301274  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  19.19 
 
 		 381 aa  50.4  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  35.4 
 
 		 401 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  25.89 
 
 		 399 aa  49.7  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.36 
 
 		 424 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  35.71 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  24.45 
 
 		 349 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  24.45 
 
 		 349 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  25.4 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  23.79 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  32.73 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  33.93 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  33.93 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  33.04 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0255  hypothetical protein  26.72 
 
 		 389 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  32.5 
 
 		 397 aa  46.6  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  22.87 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  27.1 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  21.77 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  32.17 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  22.92 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  26.79 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  25.47 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>