More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1687 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 243 aa  490  9.999999999999999e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0559  transcriptional regulator  74.79 
 
 		 242 aa  379  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000128597  hitchhiker  0.00000147754 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  61.16 
 
 		 242 aa  321  8e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 239 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  30.91 
 
 		 247 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  31.36 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  32.17 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0249  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0255  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.49 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  30.67 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 239 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 245 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3202  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 237 aa  103  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  29.86 
 
 		 233 aa  103  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  27.82 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3436  transcriptional regulator, GntR family  28.96 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 245 aa  101  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  29.6 
 
 		 260 aa  101  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  23.87 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  23.87 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  23.87 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 249 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 240 aa  95.1  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0420  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.330179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0456  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0188  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0560306 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 244 aa  93.6  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 248 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 239 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2301  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  27.52 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  33.12 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 267 aa  89  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  26.22 
 
 		 236 aa  88.6  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  26.22 
 
 		 236 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  27.44 
 
 		 241 aa  88.6  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  27.11 
 
 		 246 aa  89  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  23.79 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  26.22 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  26.67 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5874  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  24.68 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166435  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  27.54 
 
 		 236 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  30.96 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 260 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 239 aa  86.3  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  28.24 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 238 aa  86.3  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 260 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  27.05 
 
 		 236 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  29.07 
 
 		 249 aa  85.5  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  26.97 
 
 		 195 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  27.98 
 
 		 245 aa  85.9  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  25.78 
 
 		 236 aa  85.5  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  25.78 
 
 		 236 aa  85.5  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 260 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5417  transcriptional regulator, GntR family  24.67 
 
 		 271 aa  85.1  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4198  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 262 aa  85.5  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  26.22 
 
 		 236 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 246 aa  85.1  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  26.97 
 
 		 195 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.92 
 
 		 243 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>