43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1312 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1312  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 235 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1314  peptidoglycan-binding LysM  69.41 
 
 		 253 aa  254  6e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1547  aggregation promoting factor-like surface protein  60.99 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0149607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1546  aggregation promoting factor-like surface protein  54.49 
 
 		 307 aa  151  7e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000247102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  41.89 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2148  LysM domain-containing protein  74.29 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.321456  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0415  peptidoglycan-binding LysM  62.79 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00826728  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0438  SH3 type 3 domain protein  52.5 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0696  aggregation promoting factor-like surface protein  50.68 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000939064  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1867  aggregation promoting factor-like surface protein  29.66 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  40.96 
 
 		 590 aa  53.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  40.22 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  36.36 
 
 		 293 aa  52  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  45.78 
 
 		 395 aa  48.9  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1839  aggregation promoting factor-like surface protein  48.21 
 
 		 200 aa  49.3  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1742  hypothetical protein  31.08 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.903538  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  49.15 
 
 		 307 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  35.96 
 
 		 333 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000322112  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  45.07 
 
 		 434 aa  46.6  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1816  NLP/P60 protein  48.15 
 
 		 330 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00581974  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1331  CHAP domain-containing protein  44.83 
 
 		 372 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1306  CHAP domain-containing protein  44.83 
 
 		 372 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.387302  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3176  lysM domain-containing protein  39.73 
 
 		 305 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0593  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  46.6  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000883675  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3226  peptidoglycan-binding LysM  30 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.201779 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  47.17 
 
 		 447 aa  46.2  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  45.65 
 
 		 175 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  43.75 
 
 		 568 aa  44.7  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  46.3 
 
 		 751 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2954  peptidoglycan-binding LysM  40.79 
 
 		 312 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0734  hypothetical protein  45.45 
 
 		 425 aa  42.7  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000182503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  27.04 
 
 		 333 aa  42.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000030411  hitchhiker  0.00000000000323717 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  38.57 
 
 		 142 aa  42.7  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  42.59 
 
 		 128 aa  42.4  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  32.18 
 
 		 338 aa  42.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1602  peptidoglycan-binding LysM  31.25 
 
 		 355 aa  42  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000032696  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  52.27 
 
 		 429 aa  42  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0051  peptidoglycan-binding LysM  36.07 
 
 		 436 aa  42  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.492826  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  38.75 
 
 		 231 aa  42  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03621  LysM domain-containing protein  42.86 
 
 		 253 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.624755  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  36.59 
 
 		 587 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  42.59 
 
 		 253 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>