More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0658 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 
438 aa  887  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.77499e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  62.1 
 
 
437 aa  510  1e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  63.07 
 
 
435 aa  503  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  61.64 
 
 
439 aa  499  1e-140  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  59.59 
 
 
437 aa  477  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  60.23 
 
 
428 aa  467  1e-130  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  59.77 
 
 
432 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  59.54 
 
 
428 aa  460  1e-128  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  56.49 
 
 
427 aa  445  1e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  57.44 
 
 
428 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  56.98 
 
 
428 aa  440  1e-122  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  54.13 
 
 
430 aa  441  1e-122  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  54.13 
 
 
430 aa  441  1e-122  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  56.75 
 
 
428 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  56.52 
 
 
428 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  56.32 
 
 
428 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  56.29 
 
 
428 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  56.29 
 
 
428 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  56.52 
 
 
428 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  56.52 
 
 
428 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  56.29 
 
 
428 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  52.98 
 
 
430 aa  432  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  4.54316e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  57.14 
 
 
436 aa  430  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  49.89 
 
 
422 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.51 
 
 
426 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.68 
 
 
426 aa  373  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  2.64035e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  49.54 
 
 
419 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.34 
 
 
425 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.12054e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.58 
 
 
425 aa  362  8e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  47.83 
 
 
427 aa  362  8e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  1.27765e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.77 
 
 
417 aa  349  5e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  47.03 
 
 
424 aa  348  9e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  44.95 
 
 
423 aa  343  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  50 
 
 
423 aa  341  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.95 
 
 
437 aa  337  2e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  46.5 
 
 
428 aa  336  6e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  46.5 
 
 
428 aa  336  6e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  44.6 
 
 
435 aa  333  4e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  44.6 
 
 
435 aa  331  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.22 
 
 
429 aa  327  2e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.69 
 
 
452 aa  326  4e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  49.54 
 
 
424 aa  323  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  52.82 
 
 
338 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  43.78 
 
 
440 aa  315  1e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  47.7 
 
 
439 aa  314  2e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  49.77 
 
 
425 aa  314  2e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  52.51 
 
 
346 aa  312  9e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.77 
 
 
426 aa  310  2e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  51.53 
 
 
338 aa  310  3e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.6 
 
 
439 aa  310  3e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.97 
 
 
482 aa  310  3e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  7.15993e-05  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.48 
 
 
350 aa  308  1e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.62 
 
 
454 aa  307  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.35 
 
 
333 aa  304  2e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.14 
 
 
464 aa  302  7e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  1.09453e-12 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  50 
 
 
338 aa  300  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.12232e-08  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  42.79 
 
 
434 aa  299  7e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  46.99 
 
 
357 aa  298  2e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  49.69 
 
 
338 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  9.9426e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  52.59 
 
 
343 aa  297  3e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  49.39 
 
 
338 aa  296  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.4 
 
 
435 aa  296  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  52.24 
 
 
329 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  52.24 
 
 
329 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.42 
 
 
458 aa  295  8e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  50.76 
 
 
387 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.09 
 
 
464 aa  294  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.47894e-05  hitchhiker  3.62877e-14 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.21 
 
 
463 aa  293  3e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  46.72 
 
 
357 aa  293  5e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  48.91 
 
 
356 aa  290  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  50.91 
 
 
353 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02961  GTPase ObgE  51.99 
 
 
329 aa  289  7e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115383  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  50.74 
 
 
354 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1586  GTPase ObgE  51.99 
 
 
329 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.928628  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  50.74 
 
 
354 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  50.44 
 
 
354 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  46.76 
 
 
338 aa  287  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  48.47 
 
 
338 aa  288  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  47.4 
 
 
358 aa  287  3e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.91 
 
 
428 aa  287  3e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  48.92 
 
 
327 aa  286  4e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  51.76 
 
 
342 aa  286  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  41.19 
 
 
424 aa  286  5e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.3 
 
 
336 aa  285  9e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  40.9 
 
 
439 aa  285  1e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  41.78 
 
 
424 aa  285  1e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  46.24 
 
 
395 aa  285  1e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  47.25 
 
 
406 aa  284  2e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.58 
 
 
491 aa  284  2e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  51.2 
 
 
352 aa  283  3e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  48.67 
 
 
346 aa  283  5e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  5.91605e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  40.05 
 
 
500 aa  282  7e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  40.96 
 
 
424 aa  282  8e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  50.15 
 
 
337 aa  282  8e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  48.22 
 
 
397 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.28 
 
 
434 aa  281  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  49.85 
 
 
329 aa  281  2e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  43.94 
 
 
457 aa  281  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.7 
 
 
340 aa  281  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1121  GTPase ObgE  49.85 
 
 
350 aa  281  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.261529  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>