240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0397 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 229 aa  478  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  66.67 
 
 		 268 aa  313  9.999999999999999e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  62.78 
 
 		 225 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  63.64 
 
 		 223 aa  291  6e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  59.64 
 
 		 225 aa  287  9e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  60.73 
 
 		 229 aa  287  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  60.09 
 
 		 225 aa  286  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  60.09 
 
 		 225 aa  286  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  59.19 
 
 		 225 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  59.19 
 
 		 225 aa  285  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  60.73 
 
 		 224 aa  285  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  59.19 
 
 		 225 aa  285  4e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  60.09 
 
 		 225 aa  285  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  60.09 
 
 		 225 aa  285  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  59.19 
 
 		 225 aa  285  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  59.19 
 
 		 225 aa  284  8e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  58.74 
 
 		 225 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  58.3 
 
 		 225 aa  279  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  60 
 
 		 225 aa  278  6e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  56.14 
 
 		 229 aa  263  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  55.61 
 
 		 225 aa  262  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  57.59 
 
 		 233 aa  261  8e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  56.76 
 
 		 226 aa  259  2e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  56.56 
 
 		 245 aa  257  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  56.42 
 
 		 224 aa  253  3e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  54.59 
 
 		 269 aa  247  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  53.78 
 
 		 226 aa  247  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  52.47 
 
 		 241 aa  245  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  52.68 
 
 		 233 aa  244  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  52.68 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  54.79 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  55.16 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  51.63 
 
 		 225 aa  241  7e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  54.13 
 
 		 223 aa  240  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  52.83 
 
 		 216 aa  239  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  55.5 
 
 		 231 aa  238  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  51.85 
 
 		 218 aa  238  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  51.85 
 
 		 218 aa  238  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  54.59 
 
 		 240 aa  238  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  52.25 
 
 		 222 aa  237  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  54.02 
 
 		 225 aa  237  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  52.75 
 
 		 222 aa  237  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  52.44 
 
 		 228 aa  235  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  53.49 
 
 		 225 aa  235  4e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  54.09 
 
 		 247 aa  234  6e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  53.49 
 
 		 225 aa  234  9e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  54.42 
 
 		 217 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  53.92 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  53.24 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  50.68 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  53.92 
 
 		 230 aa  232  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  54.13 
 
 		 245 aa  232  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  53.24 
 
 		 231 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  52.78 
 
 		 231 aa  232  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  54.34 
 
 		 229 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 		 221 aa  229  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  53.85 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  53.27 
 
 		 228 aa  228  6e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  53.85 
 
 		 228 aa  228  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  52.68 
 
 		 261 aa  228  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  53.21 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 		 222 aa  227  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  49.56 
 
 		 227 aa  227  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  53.7 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  54.34 
 
 		 227 aa  226  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  55.02 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  54.17 
 
 		 230 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  52.8 
 
 		 228 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  51.15 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  53.7 
 
 		 230 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  52.29 
 
 		 243 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  53.95 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 		 229 aa  224  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  53.7 
 
 		 230 aa  224  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3595  uracil-DNA glycosylase  55 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2378  uracil-DNA glycosylase  54.39 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155716  normal  0.0973542 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1173  uracil-DNA glycosylase  55 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0255291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  48.86 
 
 		 231 aa  222  3e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1121  uracil-DNA glycosylase  55 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0977602  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3065  uracil-DNA glycosylase  53.39 
 
 		 229 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.550581  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  49.54 
 
 		 224 aa  221  9e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  53.85 
 
 		 232 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 		 229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  48.87 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 		 229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  54.73 
 
 		 241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 		 229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  48.4 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 		 229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 		 229 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  52.04 
 
 		 229 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1467  uracil-DNA glycosylase  52.75 
 
 		 220 aa  219  3e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0576921  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 		 229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  52.05 
 
 		 223 aa  219  3.9999999999999997e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  54.79 
 
 		 230 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 		 229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  50.68 
 
 		 244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10973  putative uracil-DNA glycosylase  50.68 
 
 		 221 aa  218  5e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 		 229 aa  218  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>