72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0152 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0152  amine oxidase  100 
 
 		 439 aa  899    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  41.07 
 
 		 435 aa  339  5e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1802  amine oxidase  41.15 
 
 		 439 aa  317  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000252839  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0884  amine oxidase  37.5 
 
 		 438 aa  282  8.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  24.31 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  22.65 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  21.41 
 
 		 469 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  22.8 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  20.86 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  21.4 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  24.37 
 
 		 491 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  20.69 
 
 		 469 aa  54.3  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  26.77 
 
 		 473 aa  53.5  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  22.81 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  23.6 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  20.89 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  24.54 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  23.77 
 
 		 452 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  23.91 
 
 		 496 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  43.55 
 
 		 492 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  43.4 
 
 		 361 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  21.88 
 
 		 488 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  21.17 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  34.88 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  23.46 
 
 		 475 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  30.48 
 
 		 465 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  22.2 
 
 		 477 aa  48.5  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  41.94 
 
 		 503 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  44.23 
 
 		 624 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  35.9 
 
 		 456 aa  46.6  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  52.38 
 
 		 592 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  22.95 
 
 		 628 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  23.08 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  30.53 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  30.53 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  45.28 
 
 		 557 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  30.53 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  23.08 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1547  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.52 
 
 		 530 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  33.67 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  46.3 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  20.97 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  42.37 
 
 		 474 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  42 
 
 		 359 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1091  putative cyclopropane/cyclopropene fatty acid synthesis protein, flavin amine oxidase  41.05 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  39.34 
 
 		 358 aa  45.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2754  amine oxidase  41.05 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  43.4 
 
 		 489 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1883  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  46.51 
 
 		 735 aa  44.3  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.692001  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  26.72 
 
 		 344 aa  44.3  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  30.26 
 
 		 537 aa  44.3  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  27.27 
 
 		 647 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  45 
 
 		 645 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5210  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.92 
 
 		 517 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  45 
 
 		 494 aa  44.3  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  21.01 
 
 		 490 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  27.27 
 
 		 647 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  23.21 
 
 		 460 aa  43.9  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  38.33 
 
 		 383 aa  43.9  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  50 
 
 		 625 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  36.21 
 
 		 328 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  41.18 
 
 		 496 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2937  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 430 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187359  normal  0.0531334 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 		 346 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  36.21 
 
 		 328 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  40.68 
 
 		 451 aa  43.5  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  25.05 
 
 		 417 aa  43.5  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  20.08 
 
 		 473 aa  43.1  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  42.31 
 
 		 504 aa  43.1  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  47.37 
 
 		 516 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  22.15 
 
 		 447 aa  43.1  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  30.26 
 
 		 533 aa  43.1  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>