49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4064 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4064  FHA domain-containing protein  100 
 
 		 580 aa  1123    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000372597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  50.79 
 
 		 554 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26770  hypothetical protein  41.27 
 
 		 565 aa  150  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0208  FHA domain containing protein  41.97 
 
 		 645 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3841  FHA domain-containing protein  41.55 
 
 		 681 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388095  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  39.57 
 
 		 480 aa  136  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2971  FHA domain-containing protein  33.76 
 
 		 477 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2846  FHA domain-containing protein  33.76 
 
 		 478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0442  FHA domain-containing protein  33.44 
 
 		 478 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1773  FHA domain-containing protein  33.44 
 
 		 478 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701606  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1588  FHA domain-containing protein  33.44 
 
 		 478 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.786308  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1210  FHA domain-containing protein  33.76 
 
 		 478 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0393  FHA domain-containing protein  33.44 
 
 		 478 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.280068  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1468  FHA domain-containing protein  38.86 
 
 		 777 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0249  FHA domain-containing protein  37.77 
 
 		 460 aa  126  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1597  FHA domain-containing protein  35.44 
 
 		 485 aa  126  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177216  normal  0.583797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  37.5 
 
 		 508 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2456  FHA domain containing protein  31.94 
 
 		 604 aa  117  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.204622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  39.88 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00970  hypothetical protein  36.53 
 
 		 180 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00615809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3006  FHA domain-containing protein  31.82 
 
 		 572 aa  104  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  37.77 
 
 		 463 aa  102  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2377  FHA domain-containing protein  22.54 
 
 		 458 aa  99  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3127  FHA domain-containing protein  33.21 
 
 		 409 aa  90.1  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00194716  normal  0.0847804 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3483  hypothetical protein  31.94 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2449  FHA domain-containing protein  32.97 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.01697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2355  FHA domain containing protein  30.41 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  30.85 
 
 		 541 aa  83.6  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  31.61 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  32.32 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42950  hypothetical protein  28.64 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.171842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  30.36 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  26.32 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  32.05 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  39.09 
 
 		 433 aa  67  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  24.4 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3728  FHA domain-containing protein  26.04 
 
 		 436 aa  60.1  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1526  FHA domain-containing protein  35.11 
 
 		 398 aa  55.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00980  hypothetical protein  41.56 
 
 		 319 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3045  FHA domain-containing protein  38.24 
 
 		 174 aa  51.6  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000453276  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5478  FHA domain containing protein  41.46 
 
 		 673 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366631  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.89 
 
 		 1004 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3464  FHA domain containing protein  31.76 
 
 		 694 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0731719  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1106  hypothetical protein  22.87 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1225  hypothetical protein  22.87 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.728798 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  34.57 
 
 		 1157 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2802  FHA domain containing protein  23.43 
 
 		 409 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.824503  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3250  putative FHA domain containing protein  23.43 
 
 		 406 aa  43.9  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  39.19 
 
 		 1167 aa  43.9  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>