154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3817 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  100 
 
 		 310 aa  614  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3183  biotin synthesis protein BioC  51.27 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1672  biotin synthesis protein BioC  44.41 
 
 		 300 aa  225  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  47.37 
 
 		 300 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1679  hypothetical protein  46.55 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1187  hypothetical protein  47.41 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4394  biotin synthesis protein BioC  46.2 
 
 		 304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1243  biotin synthesis protein BioC  44.22 
 
 		 300 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  44.79 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  44.44 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3908  biotin synthesis protein BioC  44.77 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  41.09 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  38.02 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0216  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.320783 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  41.38 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0235  Methyltransferase type 11  40.23 
 
 		 313 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  36.04 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  40.75 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  41.49 
 
 		 320 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  40.74 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  37.25 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  37.25 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 319 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  41.2 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  42.62 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  39.29 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  35.64 
 
 		 338 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  38.52 
 
 		 338 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  38.52 
 
 		 338 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  35.23 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  38.52 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  38.52 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  38.52 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  38.52 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  38.19 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  38.19 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  37.54 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.32 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  33.86 
 
 		 284 aa  139  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  37.86 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  33.46 
 
 		 284 aa  139  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  39.16 
 
 		 321 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  38.35 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  31.03 
 
 		 309 aa  135  9e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  37.65 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  35.95 
 
 		 294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  32.81 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  33.86 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  33.86 
 
 		 281 aa  120  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  33.06 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  31.71 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  31.65 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  31.71 
 
 		 295 aa  109  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1646  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.735409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  29.76 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1941  methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  32.52 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  29.34 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  28.4 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  28.9 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  30.08 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  29.48 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  30.08 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  30 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58842  predicted protein  22.82 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.040839  decreased coverage  0.00802664 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  30.63 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0028  hypothetical protein  28.97 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  25.59 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2265  methyltransferase type 11  31.1 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  27.73 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  28.46 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  27.8 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  29.67 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  27.73 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  27.31 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  28.49 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.588911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  31.67 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  26.97 
 
 		 558 aa  62.8  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  26.44 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  32.5 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  28.21 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0294  hypothetical protein  34.43 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 267 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  23.05 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  25.62 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  28.95 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  27.08 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3499  SAM-dependent methyltransferase  32.74 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  28.3 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0668  hypothetical protein  26.75 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>