71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1410 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  76.04 
 
 
1009 aa  1560    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  100 
 
 
1025 aa  2064    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  67.93 
 
 
1002 aa  1364    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1413  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  83.51 
 
 
437 aa  333  7.000000000000001e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00657496  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2488  glycoside hydrolase family 68  28.85 
 
 
471 aa  122  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1938  Levansucrase  29.59 
 
 
436 aa  112  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3405  Beta-fructofuranosidase  26.03 
 
 
473 aa  111  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.83791 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4097  Beta-fructofuranosidase  27.16 
 
 
451 aa  109  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4171  levansucrase  26.34 
 
 
526 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0733922  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3698  levansucrase  26.34 
 
 
526 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2102  levansucrase precursor  25.7 
 
 
521 aa  100  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1872  levansucrase  27.54 
 
 
509 aa  100  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  28.93 
 
 
1363 aa  100  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0466  levansucrase  25.7 
 
 
521 aa  99.8  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1010  levansucrase  25.7 
 
 
494 aa  99.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.450168  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0714  levansucrase  25.7 
 
 
494 aa  99.4  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1984  levansucrase  25.7 
 
 
494 aa  99.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0735  levansucrase  25.7 
 
 
494 aa  98.2  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0822  levansucrase  25.7 
 
 
494 aa  97.8  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6047  levansucrase  26.91 
 
 
531 aa  97.8  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000164133  hitchhiker  0.00000266409 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4270  levansucrase  26.23 
 
 
527 aa  97.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169981  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4096  levansucrase  26.23 
 
 
527 aa  97.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0480075  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6116  levansucrase  27.95 
 
 
531 aa  96.3  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.116097 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3247  levansucrase  26.23 
 
 
527 aa  96.3  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.36332  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  28.95 
 
 
532 aa  92  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  38.54 
 
 
420 aa  89  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2103  levansucrase  26.27 
 
 
415 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962759  decreased coverage  0.00209256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2305  levansucrase  24.72 
 
 
415 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0754  levansucrase  25.13 
 
 
431 aa  86.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1365  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.43 
 
 
514 aa  85.5  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0022042  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0032  levansucrase  25.28 
 
 
431 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49796  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  33.97 
 
 
474 aa  83.6  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1453  levansucrase  25 
 
 
431 aa  83.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118885  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2021  levansucrase  25.16 
 
 
534 aa  82  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00566302  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0964  levansucrase  23.59 
 
 
385 aa  75.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0405  levansucrase  23.74 
 
 
522 aa  75.9  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1531  Levansucrase  26.19 
 
 
584 aa  72.4  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.515752  normal  0.219322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0616  Levansucrase  23.94 
 
 
532 aa  72.4  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161634 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  27.66 
 
 
651 aa  67  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1879  levansucrase  23.72 
 
 
377 aa  66.6  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  26.84 
 
 
1527 aa  64.3  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  27.92 
 
 
512 aa  60.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  29.79 
 
 
807 aa  60.1  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  29.61 
 
 
2495 aa  58.2  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  25.42 
 
 
602 aa  57  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  31.1 
 
 
502 aa  56.6  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  31.77 
 
 
2313 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  26.06 
 
 
552 aa  55.5  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  24.91 
 
 
550 aa  55.5  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  24.6 
 
 
2821 aa  55.1  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  33.87 
 
 
440 aa  54.3  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0615  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.7 
 
 
341 aa  53.5  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.131346  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  26.27 
 
 
430 aa  53.5  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  31.4 
 
 
184 aa  52.4  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  26.6 
 
 
1408 aa  52.4  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  24.65 
 
 
811 aa  52  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  37.84 
 
 
1131 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  36.84 
 
 
331 aa  50.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  37.84 
 
 
1131 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0986  CpcD phycobilisome linker-like  24.34 
 
 
310 aa  48.9  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0488106  normal  0.231537 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  34.21 
 
 
697 aa  48.5  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  22.75 
 
 
613 aa  48.5  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  25.9 
 
 
1475 aa  48.5  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  32.86 
 
 
203 aa  48.1  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  27.74 
 
 
465 aa  47.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  23.81 
 
 
573 aa  47.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  27.54 
 
 
478 aa  46.6  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  26.5 
 
 
1514 aa  46.2  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  28.51 
 
 
342 aa  45.8  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1206  hypothetical protein  28.38 
 
 
854 aa  45.4  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  29.17 
 
 
891 aa  45.1  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>