More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1846 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  100 
 
 		 568 aa  1086    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  49.12 
 
 		 533 aa  412  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  38.57 
 
 		 520 aa  332  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  38.03 
 
 		 531 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  35.43 
 
 		 515 aa  274  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  34.58 
 
 		 518 aa  243  7e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  38.87 
 
 		 479 aa  190  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0761  CheW protein  33.4 
 
 		 475 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.951826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  22.69 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  25.43 
 
 		 528 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  45.65 
 
 		 165 aa  107  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  40.54 
 
 		 164 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  47.75 
 
 		 158 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  38.97 
 
 		 148 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  48.65 
 
 		 158 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  46.85 
 
 		 158 aa  101  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.73 
 
 		 164 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  39.57 
 
 		 168 aa  99.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  37.91 
 
 		 167 aa  99  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  40.54 
 
 		 163 aa  98.2  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  37.16 
 
 		 164 aa  96.3  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  38.41 
 
 		 168 aa  95.9  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  49.06 
 
 		 165 aa  95.1  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  42.61 
 
 		 165 aa  94  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  42.61 
 
 		 165 aa  94  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  43.75 
 
 		 166 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  44.86 
 
 		 169 aa  93.2  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  34.59 
 
 		 163 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  40.13 
 
 		 158 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  38.93 
 
 		 189 aa  92  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  36.11 
 
 		 165 aa  91.3  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  38.16 
 
 		 164 aa  90.9  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  38.16 
 
 		 163 aa  90.9  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  37.5 
 
 		 165 aa  90.5  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  38.16 
 
 		 161 aa  90.5  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  37.5 
 
 		 165 aa  90.5  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  36.36 
 
 		 167 aa  90.5  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  48.67 
 
 		 164 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  37.78 
 
 		 139 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  41.9 
 
 		 162 aa  89.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  38.57 
 
 		 147 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  38.16 
 
 		 159 aa  88.6  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  33.13 
 
 		 183 aa  87.8  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  40.44 
 
 		 163 aa  88.2  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  36.96 
 
 		 136 aa  87.8  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  33.54 
 
 		 169 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  36.08 
 
 		 161 aa  86.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  36.51 
 
 		 146 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  36.18 
 
 		 164 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.5 
 
 		 164 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  36.42 
 
 		 159 aa  85.9  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  33.33 
 
 		 218 aa  86.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  36.54 
 
 		 145 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  33.56 
 
 		 161 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  35.62 
 
 		 162 aa  85.5  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  35.62 
 
 		 164 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  35.88 
 
 		 154 aa  84.7  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  32.43 
 
 		 150 aa  84.7  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  34.04 
 
 		 163 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  35.88 
 
 		 154 aa  84.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.18 
 
 		 164 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  36.18 
 
 		 164 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  36.18 
 
 		 164 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  36.18 
 
 		 164 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  30.86 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2578  purine-binding chemotaxis protein CheW  35 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  35.19 
 
 		 163 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  36.18 
 
 		 164 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  35.62 
 
 		 164 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  35.19 
 
 		 163 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  36.18 
 
 		 164 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  36.18 
 
 		 164 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  36.18 
 
 		 164 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  34.87 
 
 		 158 aa  82.8  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  33.77 
 
 		 159 aa  82.4  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  34.93 
 
 		 163 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  40.78 
 
 		 171 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  32.26 
 
 		 170 aa  81.6  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  38.3 
 
 		 163 aa  81.6  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  35.14 
 
 		 166 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  33.99 
 
 		 169 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  33.99 
 
 		 169 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  35.1 
 
 		 162 aa  81.3  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2054  CheW protein  28.11 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.665842  hitchhiker  0.000288851 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  36.03 
 
 		 164 aa  80.9  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  31.91 
 
 		 146 aa  80.5  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  32.43 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  35.53 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  35.1 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  34.81 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  34.06 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  32.88 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  31.91 
 
 		 146 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  30.3 
 
 		 171 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  34.04 
 
 		 164 aa  80.1  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2361  CheW protein  26.06 
 
 		 342 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  30.07 
 
 		 167 aa  79  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  33.11 
 
 		 170 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  33.11 
 
 		 170 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  32.69 
 
 		 161 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>