79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1438 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1438  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 291 aa  570  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4024  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.88 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2679  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.66 
 
 		 297 aa  92.8  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00635777  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3504  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.42 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.45027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.58 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.86 
 
 		 591 aa  76.3  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.94 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  32.2 
 
 		 639 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.31 
 
 		 639 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.23 
 
 		 236 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.65 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.74 
 
 		 312 aa  65.5  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1208  hypothetical protein  26.52 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.5 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.81 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.81 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.72 
 
 		 808 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.24 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.52 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.18 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.03 
 
 		 837 aa  59.3  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.15 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.15 
 
 		 644 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.07 
 
 		 264 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.09 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.12 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.68 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.77 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.8 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.17 
 
 		 242 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7068  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.21 
 
 		 1007 aa  52.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332521  normal  0.746742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.87 
 
 		 269 aa  52.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  30.77 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.24 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2668  hypothetical protein  26.79 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.621647  normal  0.164223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.53 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.46 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.81 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.63 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  31.53 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5052  hypothetical protein  25.9 
 
 		 511 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.164457 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0008  hypothetical protein  29.05 
 
 		 244 aa  49.3  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326697  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.67 
 
 		 279 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.22 
 
 		 338 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.52 
 
 		 281 aa  48.9  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.39 
 
 		 1153 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.19 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3092  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3150  hypothetical protein  30.88 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.67 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 576 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36680  hypothetical protein  31.07 
 
 		 245 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4283  Metal-dependent exonuclease protein  28.71 
 
 		 286 aa  46.2  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1684  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.39 
 
 		 259 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.433649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  30.3 
 
 		 657 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.47 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0494  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.11 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.303046  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  31.19 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.23 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0727  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.99 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.212746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1779  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.17 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.18 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.55 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0458  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.76 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.41 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.49 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1052  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.44 
 
 		 287 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00191941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  28.64 
 
 		 273 aa  43.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.82 
 
 		 340 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0181271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2424  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.11 
 
 		 253 aa  42.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  27.05 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.49 
 
 		 265 aa  42.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1144  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.13 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  24.16 
 
 		 279 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4197  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.54 
 
 		 288 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0808  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.8 
 
 		 257 aa  42.4  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.555445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>