292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2463 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2463  HSP90 family protein  100 
 
 
621 aa  1254    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0779682  decreased coverage  0.00689697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0495  ATP-binding region ATPase domain protein  36.41 
 
 
598 aa  355  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4208  ATP-binding region ATPase domain protein  36.2 
 
 
589 aa  351  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136628  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1831  HSP90 family protein  37.52 
 
 
646 aa  347  5e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23120  molecular chaperone of HSP90 family  35.56 
 
 
641 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.139471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5466  HSP90 family protein  35.5 
 
 
585 aa  317  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2987  ATP-binding region ATPase domain protein  34.87 
 
 
622 aa  312  1e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0695  HSP90 family protein  35.48 
 
 
643 aa  302  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1779  ATP-binding region ATPase domain protein  31.8 
 
 
613 aa  291  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0267  HSP90 family protein  32.92 
 
 
661 aa  282  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.979719  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5718  Molecular chaperone HSP90 family-like protein  26.7 
 
 
872 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.903577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4376  HSP90 family molecular chaperone-like  24.35 
 
 
838 aa  130  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0800  heat shock protein 90  24 
 
 
633 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1573  heat shock protein 90  24.01 
 
 
628 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534584  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1549  heat shock protein 90  22.54 
 
 
630 aa  114  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4377  ATPase domain-containing protein  25.68 
 
 
594 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1071  heat shock protein 90  23.72 
 
 
629 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1273  heat shock protein 90  23.53 
 
 
625 aa  111  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0417  heat shock protein 90  23.45 
 
 
623 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0746567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0413  heat shock protein 90  23.45 
 
 
623 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0911  heat shock protein 90  21.05 
 
 
627 aa  108  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3230  heat shock protein 90  21.43 
 
 
614 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000011209  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1188  heat shock protein 90  23.91 
 
 
626 aa  107  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4279  Hsp90xo protein  25.34 
 
 
608 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1817  heat shock protein 90  23.43 
 
 
651 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290243  normal  0.0459301 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1764  heat shock protein 90  23.68 
 
 
615 aa  104  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000444601  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5467  heat shock protein 90  23.94 
 
 
610 aa  103  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306325  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4284  hypothetical protein  26.68 
 
 
611 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26010  TRAP1, Heat Shock Protein 90  25.06 
 
 
700 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0886232  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0495  heat shock protein 90  25.27 
 
 
620 aa  102  2e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2390  heat shock protein 90  22.22 
 
 
650 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1195  heat shock protein 90  22.13 
 
 
628 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0856  heat shock protein 90  22.15 
 
 
627 aa  99  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.585619 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0943  heat shock protein 90  25 
 
 
603 aa  99  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  21.4 
 
 
645 aa  99  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4650  heat shock protein 90  22.45 
 
 
651 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865896  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2414  heat shock protein 90  20.89 
 
 
644 aa  98.6  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2489  heat shock protein 90  24.72 
 
 
628 aa  97.4  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.356578 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2498  heat shock protein 90  21.29 
 
 
650 aa  97.1  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000559019  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0243  heat shock protein 90  24.29 
 
 
650 aa  97.1  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5302  heat shock protein 90  23.89 
 
 
628 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01954  Hsp90xo protein  26.15 
 
 
622 aa  96.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09581  heat shock protein 90  28.11 
 
 
634 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2376  heat shock protein 90  21.17 
 
 
627 aa  96.3  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175392  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09831  heat shock protein 90  26.27 
 
 
634 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09601  heat shock protein 90  24.18 
 
 
634 aa  95.9  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.237308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2143  heat shock protein 90  22.34 
 
 
644 aa  95.1  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000328119  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1404  heat shock protein 90  25.45 
 
 
634 aa  95.5  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.898305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2392  heat shock protein 90  23.34 
 
 
646 aa  95.1  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393625  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12322  heat shock protein 90  23.16 
 
 
647 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4402  heat shock protein 90  23.08 
 
 
628 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626215  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4127  heat shock protein 90  22.01 
 
 
669 aa  94.7  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745159  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4301  heat shock protein 90  25.57 
 
 
627 aa  94.7  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1472  heat shock protein 90  22.2 
 
 
615 aa  94.7  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3087  heat shock protein 90  26.78 
 
 
606 aa  94.7  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0072  heat shock protein 90  24.21 
 
 
626 aa  94.4  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2743  heat shock protein Hsp90  24.08 
 
 
677 aa  94.4  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1459  ATP-binding region ATPase domain protein  23.9 
 
 
610 aa  94  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal  0.894104 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0851  heat shock protein 90  25.77 
 
 
643 aa  94  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415809  normal  0.667015 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4692  heat shock protein 90  23.49 
 
 
628 aa  94  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595162  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0920  heat shock protein 90  25.77 
 
 
643 aa  93.6  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0614  heat shock protein 90  22.72 
 
 
626 aa  93.2  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00438217  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1028  heat shock protein 90  22.81 
 
 
626 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162426  normal  0.169491 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1735  heat shock protein 90  22.94 
 
 
632 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1155  heat shock protein 90  22.81 
 
 
626 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  22.94 
 
 
632 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  22.94 
 
 
632 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2852  heat shock protein 90  21.97 
 
 
669 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1728  heat shock protein 90  25.76 
 
 
645 aa  93.6  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000167687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1326  heat shock protein 90  23.86 
 
 
624 aa  93.6  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  22.94 
 
 
632 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5199  heat shock protein 90  24.02 
 
 
610 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661804  normal  0.486638 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1127  heat shock protein 90  21.08 
 
 
636 aa  92.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618251  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2812  heat shock protein 90  24.38 
 
 
637 aa  92.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20340  heat shock protein 90  23.2 
 
 
644 aa  92.8  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3701  Heat shock protein Hsp90-like protein  25.2 
 
 
640 aa  92.8  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93558  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4168  heat shock protein 90  23.67 
 
 
629 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.160009  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3587  heat shock protein 90  22.58 
 
 
629 aa  92.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15251  heat shock protein 90  24.71 
 
 
636 aa  92  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4309  HSP90 family protein  29.24 
 
 
617 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2214  heat shock protein 90  22.41 
 
 
642 aa  92  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000258546  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6991  heat shock protein Hsp90  22.61 
 
 
611 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854649 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50590  HSP90 family protein  28.99 
 
 
636 aa  92  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1216  heat shock protein 90  22.4 
 
 
632 aa  92  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0416  heat shock protein 90  22.65 
 
 
633 aa  91.7  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000647765  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3329  heat shock protein 90  22.66 
 
 
634 aa  91.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  22.14 
 
 
630 aa  91.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5294  heat shock protein 90  21.81 
 
 
636 aa  91.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117014  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0703  heat shock protein 90  22.12 
 
 
609 aa  91.3  5e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2005  heat shock protein 90  24.23 
 
 
656 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1086  heat shock protein 90  21.46 
 
 
623 aa  90.9  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0960  heat shock protein 90  22.81 
 
 
626 aa  90.9  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.515332  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2383  heat shock protein 90  22.64 
 
 
632 aa  90.9  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1147  heat shock protein 90  21.67 
 
 
636 aa  90.9  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30595  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1771  heat shock protein 90  22.65 
 
 
633 aa  90.5  8e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000171528  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1320  heat shock protein 90  22.63 
 
 
623 aa  89.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2009  heat shock protein 90  19.23 
 
 
613 aa  89.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0506  heat shock protein 90  21.09 
 
 
635 aa  90.1  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1407  Heat shock protein Hsp90-like protein  21.32 
 
 
623 aa  90.1  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0607  heat shock protein 90  24.22 
 
 
637 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>