293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4284 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1146  Hsp90xo protein  57.43 
 
 
618 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4284  hypothetical protein  100 
 
 
611 aa  1256    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4279  Hsp90xo protein  90.94 
 
 
608 aa  1148    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01954  Hsp90xo protein  57.62 
 
 
622 aa  691    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50590  HSP90 family protein  57.69 
 
 
636 aa  674    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4309  HSP90 family protein  57.53 
 
 
617 aa  671    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4376  HSP90 family molecular chaperone-like  28.64 
 
 
838 aa  210  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5718  Molecular chaperone HSP90 family-like protein  29.83 
 
 
872 aa  183  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.903577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4377  ATPase domain-containing protein  28.22 
 
 
594 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5466  HSP90 family protein  28.37 
 
 
585 aa  175  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1831  HSP90 family protein  32.81 
 
 
646 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0695  HSP90 family protein  34.64 
 
 
643 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4208  ATP-binding region ATPase domain protein  33.5 
 
 
589 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136628  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2987  ATP-binding region ATPase domain protein  28.01 
 
 
622 aa  156  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0495  ATP-binding region ATPase domain protein  30.75 
 
 
598 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4168  heat shock protein 90  28.94 
 
 
629 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.160009  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4301  heat shock protein 90  30.96 
 
 
627 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1573  heat shock protein 90  26.81 
 
 
628 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00534584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0267  HSP90 family protein  31.83 
 
 
661 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.979719  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1071  heat shock protein 90  26.47 
 
 
629 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1273  heat shock protein 90  26.5 
 
 
625 aa  141  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1779  ATP-binding region ATPase domain protein  27.44 
 
 
613 aa  140  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09601  heat shock protein 90  25.72 
 
 
634 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.237308  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23120  molecular chaperone of HSP90 family  29.42 
 
 
641 aa  137  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.139471 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0873  heat shock protein 90  27.58 
 
 
628 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000721641  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1017  heat shock protein 90  27.58 
 
 
628 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000769643  normal  0.045663 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09831  heat shock protein 90  24.74 
 
 
634 aa  137  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09581  heat shock protein 90  25.2 
 
 
634 aa  137  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0306  heat shock protein 90  25 
 
 
634 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0856617  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1188  heat shock protein 90  25.46 
 
 
626 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09791  heat shock protein 90  24.49 
 
 
634 aa  134  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.275736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0960  heat shock protein 90  29.38 
 
 
626 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.515332  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5467  heat shock protein 90  28.94 
 
 
610 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306325  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0899  heat shock protein 90  24.67 
 
 
634 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.460903  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1155  heat shock protein 90  29.1 
 
 
626 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1028  heat shock protein 90  29.1 
 
 
626 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162426  normal  0.169491 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2002  heat shock protein 90  27.42 
 
 
613 aa  131  4.0000000000000003e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.240397 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1195  heat shock protein 90  26.02 
 
 
628 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1800  heat shock protein Hsp90  27.46 
 
 
646 aa  130  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0506  heat shock protein 90  26.9 
 
 
635 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3230  heat shock protein 90  25 
 
 
614 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000011209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0800  heat shock protein 90  25.21 
 
 
633 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1549  heat shock protein 90  26.8 
 
 
630 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678256  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2370  heat shock protein 90  27.75 
 
 
642 aa  127  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0508031  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0856  heat shock protein 90  24.15 
 
 
627 aa  127  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.585619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2342  heat shock protein 90  28.27 
 
 
633 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0450  heat shock protein 90  26.3 
 
 
626 aa  126  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2376  heat shock protein 90  25.6 
 
 
627 aa  125  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175392  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0911  heat shock protein 90  25.54 
 
 
627 aa  124  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08591  heat shock protein 90  24.48 
 
 
632 aa  124  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.559201  hitchhiker  0.00238922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0322  heat shock protein 90  27.1 
 
 
624 aa  123  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2009  heat shock protein 90  25.19 
 
 
613 aa  123  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13490  heat shock protein 90  26.39 
 
 
632 aa  123  9e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0452  heat shock protein 90  26.9 
 
 
629 aa  123  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  26.79 
 
 
639 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000100055  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2489  heat shock protein 90  28.38 
 
 
628 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.356578 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0417  heat shock protein 90  24.69 
 
 
623 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0746567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0413  heat shock protein 90  24.69 
 
 
623 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0752  heat shock protein 90  25.93 
 
 
633 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1472  heat shock protein 90  26.82 
 
 
615 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0192  heat shock protein 90  26.1 
 
 
646 aa  122  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5302  heat shock protein 90  26.87 
 
 
628 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0117  heat shock protein 90  24.26 
 
 
631 aa  121  3.9999999999999996e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3587  heat shock protein 90  26.81 
 
 
629 aa  121  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1006  heat shock protein 90  26.77 
 
 
612 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.511721  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2506  heat shock protein 90  26.91 
 
 
633 aa  120  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595688  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  27.96 
 
 
634 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1404  heat shock protein 90  25.14 
 
 
634 aa  120  7e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.898305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1326  heat shock protein 90  27.44 
 
 
624 aa  120  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  26.9 
 
 
633 aa  120  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_55215  heat shock protein Hsp90  24.31 
 
 
780 aa  120  7.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  25.68 
 
 
637 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2099  heat shock protein 90  25.61 
 
 
635 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130933  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0435  ATP-binding region ATPase domain protein  26.54 
 
 
640 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004137  chaperone protein HtpG  25.82 
 
 
634 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2414  heat shock protein 90  24.53 
 
 
644 aa  118  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1803  heat shock protein 90  24.8 
 
 
644 aa  118  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102063 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0860  heat shock protein Hsp90  26.06 
 
 
628 aa  118  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1764  heat shock protein 90  24.22 
 
 
615 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000444601  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  28.88 
 
 
630 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0851  heat shock protein 90  25.67 
 
 
643 aa  117  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415809  normal  0.667015 
 
 
-
 
NC_002950  PG0045  heat shock protein 90  23.48 
 
 
684 aa  116  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0416  heat shock protein 90  25.93 
 
 
633 aa  116  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000647765  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  25.41 
 
 
635 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0920  heat shock protein 90  25.67 
 
 
643 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1082  heat shock protein 90  26.42 
 
 
634 aa  116  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18793  predicted protein  24.74 
 
 
750 aa  116  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0044  heat shock protein 90  28.61 
 
 
611 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  26.29 
 
 
634 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  27.32 
 
 
634 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  26.83 
 
 
634 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0296  heat shock protein 90  26.39 
 
 
636 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0044  heat shock protein 90  28.08 
 
 
611 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4692  heat shock protein 90  25.46 
 
 
628 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595162  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0492  heat shock protein 90  22.33 
 
 
634 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138197  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15251  heat shock protein 90  24.71 
 
 
636 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  26.29 
 
 
634 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1375  heat shock protein 90  23.88 
 
 
645 aa  115  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000122327  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1771  heat shock protein 90  25.93 
 
 
633 aa  115  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000171528  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  26.29 
 
 
634 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>