175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1159 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  100 
 
 		 231 aa  438  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  41.59 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  43.87 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  41.78 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  48.82 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  40.41 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  39.9 
 
 		 187 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  42.08 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  42.27 
 
 		 188 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  40.76 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  33.16 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  38.22 
 
 		 197 aa  101  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  39.25 
 
 		 192 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  35.59 
 
 		 180 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  34.15 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  38.92 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  34.04 
 
 		 182 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  38.1 
 
 		 192 aa  96.7  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  36.7 
 
 		 179 aa  96.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  34.72 
 
 		 187 aa  95.9  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  33.15 
 
 		 191 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  32.07 
 
 		 191 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  34.04 
 
 		 184 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  34.04 
 
 		 184 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  35.38 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  31.52 
 
 		 191 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  40.19 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  30.94 
 
 		 189 aa  91.7  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  38.38 
 
 		 180 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  35.23 
 
 		 187 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  32.64 
 
 		 201 aa  89  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  39.9 
 
 		 194 aa  89  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1540  BioY protein  39.9 
 
 		 194 aa  88.2  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  32.67 
 
 		 205 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  30.57 
 
 		 189 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  33 
 
 		 197 aa  85.9  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  33.33 
 
 		 207 aa  85.5  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  33.03 
 
 		 208 aa  85.5  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  34.39 
 
 		 182 aa  85.1  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  33.68 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  33.67 
 
 		 187 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  39.75 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  33.13 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  33.13 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  33.13 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  38.27 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  38.06 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  45.92 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  30.05 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  33.69 
 
 		 184 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  32.07 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  28.72 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  39.22 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  32.99 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  35.71 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  33.5 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  29.02 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  32.61 
 
 		 191 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  33.95 
 
 		 178 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5454  BioY protein  36.53 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0263826  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  58.9 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  34.21 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  58.02 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  30.05 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  34.64 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  31.52 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  31.52 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  35.67 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  47.06 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  35.67 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3386  BioY protein  32.84 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.812512  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  43.93 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20560  hypothetical protein  35.18 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  41.48 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  49.41 
 
 		 203 aa  72  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  30.43 
 
 		 191 aa  72  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  30.43 
 
 		 191 aa  72  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  30.43 
 
 		 191 aa  72  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  52.56 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  37.01 
 
 		 205 aa  71.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  40.18 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  37.89 
 
 		 179 aa  71.2  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  30.37 
 
 		 167 aa  71.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  42.48 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  29.71 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  36.9 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  47.67 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2314  hypothetical protein  38.36 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.462217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  45.71 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  40.57 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0733  BioY protein  28.08 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  48.84 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  44.72 
 
 		 181 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  52.38 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  48.84 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  41 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  28.65 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  28.65 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  28.65 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  45.19 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>