More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1464 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1464  ABC transporter related  100 
 
 
496 aa  991    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00931771  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0578  ABC transporter related  47.52 
 
 
488 aa  431  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.036841  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  38.28 
 
 
522 aa  303  7.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  39.29 
 
 
544 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  36.67 
 
 
503 aa  299  8e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  39.29 
 
 
544 aa  293  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  35.22 
 
 
497 aa  292  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  33.73 
 
 
503 aa  290  6e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  33.86 
 
 
499 aa  289  8e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2744  ABC transporter related protein  41.84 
 
 
501 aa  288  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0593  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.18 
 
 
514 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  33.47 
 
 
495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  34.61 
 
 
497 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2447  ABC transporter related protein  34.08 
 
 
495 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000548266  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1374  ABC transporter related protein  39.75 
 
 
505 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  33.13 
 
 
496 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6251  ABC transporter related  37.4 
 
 
508 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  35.73 
 
 
501 aa  283  6.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  32.33 
 
 
495 aa  283  6.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  35.6 
 
 
525 aa  283  6.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0708  ABC transporter related  35.03 
 
 
487 aa  281  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  38.78 
 
 
508 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0844  ABC transporter related  33.87 
 
 
515 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  35.19 
 
 
501 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  35.79 
 
 
501 aa  281  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  35.79 
 
 
501 aa  280  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  35.79 
 
 
501 aa  280  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  35.79 
 
 
501 aa  280  6e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  35.79 
 
 
501 aa  280  6e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  35.79 
 
 
501 aa  280  6e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0966  ABC transporter related  35.54 
 
 
502 aa  279  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0912  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.54 
 
 
502 aa  279  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3881  sugar transport ATP-binding protein  35.54 
 
 
502 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0578526 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  35.79 
 
 
501 aa  278  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  35.59 
 
 
501 aa  278  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  35.19 
 
 
501 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  35.98 
 
 
497 aa  278  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  35.19 
 
 
516 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  35.19 
 
 
516 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  35.19 
 
 
516 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  34.02 
 
 
505 aa  277  3e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  35.39 
 
 
501 aa  276  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  35.46 
 
 
507 aa  276  6e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1027  ABC transporter related  36.29 
 
 
502 aa  276  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.8293  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  34.99 
 
 
516 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  34.4 
 
 
501 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2366  ABC sugar (ribose) transporter, fused ATPase subunits  36.29 
 
 
502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  35.46 
 
 
507 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1140  ABC transporter related  37.47 
 
 
524 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2594  ABC transporter related  38.65 
 
 
493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98451  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  36.55 
 
 
514 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  35.05 
 
 
501 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.46 
 
 
507 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  33.94 
 
 
494 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  33.53 
 
 
501 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  33.53 
 
 
501 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11040  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  38.27 
 
 
500 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2284  ABC transporter related  32.8 
 
 
494 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  35.5 
 
 
510 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  33.33 
 
 
500 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  33.06 
 
 
504 aa  273  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  36.65 
 
 
511 aa  273  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  36.68 
 
 
509 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4172  ABC transporter related  34.26 
 
 
504 aa  272  8.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  36.55 
 
 
518 aa  272  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0397  ABC transporter related  37.4 
 
 
502 aa  272  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.13 
 
 
511 aa  272  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  31.55 
 
 
501 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  32.87 
 
 
520 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  35.46 
 
 
506 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  37.83 
 
 
500 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  31.55 
 
 
501 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  35.46 
 
 
506 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  36.14 
 
 
516 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  35.46 
 
 
501 aa  271  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.89 
 
 
516 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2029  ABC transporter related protein  36.07 
 
 
501 aa  270  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  35.02 
 
 
506 aa  270  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1920  ABC transporter related  36.57 
 
 
526 aa  270  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.528555  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  32.73 
 
 
509 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  36.18 
 
 
497 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  34.14 
 
 
499 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2667  ABC transporter related  34.24 
 
 
505 aa  269  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  36.94 
 
 
510 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  37.01 
 
 
509 aa  269  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  33 
 
 
511 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1576  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  33.54 
 
 
492 aa  268  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.369158  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3093  ABC transporter related  36.86 
 
 
501 aa  268  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.193565  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.93 
 
 
515 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  34.08 
 
 
494 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3450  ABC transporter related protein  30.33 
 
 
496 aa  268  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  33.2 
 
 
500 aa  268  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  36.63 
 
 
505 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  33.94 
 
 
499 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  32.53 
 
 
495 aa  267  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  31.88 
 
 
501 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  36.74 
 
 
521 aa  266  5.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  32.32 
 
 
499 aa  266  7e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  32.32 
 
 
499 aa  266  7e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  34.97 
 
 
517 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>