More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0578 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0578  ABC transporter related  100 
 
 		 488 aa  968    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.036841  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1464  ABC transporter related  47.52 
 
 		 496 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00931771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0593  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.28 
 
 		 514 aa  306  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  40.4 
 
 		 509 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  37.43 
 
 		 503 aa  301  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  37.77 
 
 		 514 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.16 
 
 		 516 aa  299  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  41.16 
 
 		 508 aa  295  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  38.12 
 
 		 510 aa  294  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1140  ABC transporter related  41.65 
 
 		 524 aa  292  9e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  34.82 
 
 		 499 aa  292  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0637  ABC transporter related  34.87 
 
 		 498 aa  292  1e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.011918  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  33.79 
 
 		 496 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2744  ABC transporter related protein  39.44 
 
 		 501 aa  289  6e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  36.96 
 
 		 502 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  37.35 
 
 		 497 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0700  ABC transporter related  35.96 
 
 		 492 aa  288  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000766615  hitchhiker  0.000015345 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  39.28 
 
 		 516 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  35.98 
 
 		 495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3048  ABC transporter related protein  32.68 
 
 		 513 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182553  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  35.48 
 
 		 492 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  36.76 
 
 		 522 aa  283  7.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  35.13 
 
 		 503 aa  282  8.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  38.88 
 
 		 506 aa  282  9e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4778  ABC transporter related  38.19 
 
 		 524 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  36.27 
 
 		 504 aa  281  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  34.37 
 
 		 509 aa  281  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  35.76 
 
 		 494 aa  281  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3450  ABC transporter related protein  32.3 
 
 		 496 aa  280  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  37.13 
 
 		 495 aa  281  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  34.06 
 
 		 507 aa  281  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7832  putative sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.42 
 
 		 541 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3961  L-arabinose transporter ATP-binding protein  36.57 
 
 		 515 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  37.22 
 
 		 500 aa  280  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  38.97 
 
 		 499 aa  280  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2667  ABC transporter related  37.99 
 
 		 505 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2447  ABC transporter related protein  33.8 
 
 		 495 aa  280  5e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000548266  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  34.07 
 
 		 497 aa  280  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  34.37 
 
 		 520 aa  280  6e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.55 
 
 		 506 aa  279  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3057  ABC transporter related  39.75 
 
 		 505 aa  279  7e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.242783  hitchhiker  0.00700396 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  37.97 
 
 		 511 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  38.27 
 
 		 505 aa  277  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0768  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.13 
 
 		 496 aa  276  5e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000105666  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  38.74 
 
 		 505 aa  276  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2284  ABC transporter related  34.14 
 
 		 494 aa  276  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  33.67 
 
 		 497 aa  276  8e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2599  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.89 
 
 		 509 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4172  ABC transporter related  33.79 
 
 		 504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1920  ABC transporter related  38.52 
 
 		 526 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.528555  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  36.67 
 
 		 519 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  36.2 
 
 		 506 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  38.56 
 
 		 508 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  36.01 
 
 		 499 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  38.06 
 
 		 506 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  36.01 
 
 		 499 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  37.01 
 
 		 517 aa  274  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2884  ABC transporter-like protein  38.77 
 
 		 502 aa  274  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.913699 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  34.05 
 
 		 505 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  37.1 
 
 		 521 aa  273  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  38 
 
 		 503 aa  273  6e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  34.5 
 
 		 505 aa  273  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  34.02 
 
 		 501 aa  273  7e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  34.37 
 
 		 495 aa  273  7e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  37.03 
 
 		 515 aa  273  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4757  ABC transporter related  35.2 
 
 		 516 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139896  normal  0.719575 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.38 
 
 		 518 aa  272  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  36.98 
 
 		 528 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  34.8 
 
 		 499 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  34.34 
 
 		 499 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  36.06 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4656  ABC transporter related  35.13 
 
 		 516 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489627  normal  0.659628 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  34.63 
 
 		 525 aa  272  1e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.12 
 
 		 496 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3009  L-arabinose transporter ATP-binding protein  35.2 
 
 		 509 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  36.12 
 
 		 496 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  36.42 
 
 		 506 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  38.22 
 
 		 499 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  36.25 
 
 		 513 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  36.12 
 
 		 496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  38.4 
 
 		 501 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7365  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  35.98 
 
 		 506 aa  270  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.568459  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  36.78 
 
 		 506 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  33.54 
 
 		 492 aa  269  7e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  34.14 
 
 		 499 aa  269  8e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  36.58 
 
 		 520 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  30.97 
 
 		 504 aa  269  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4323  ABC transporter related protein  38.65 
 
 		 507 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  35.71 
 
 		 507 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  34.49 
 
 		 523 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  34.49 
 
 		 523 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  35.67 
 
 		 507 aa  268  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  31.57 
 
 		 500 aa  268  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  32.88 
 
 		 501 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  34 
 
 		 495 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  36.56 
 
 		 517 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  36.63 
 
 		 517 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0844  ABC transporter related  34.74 
 
 		 515 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0249  ABC transporter component  35.67 
 
 		 493 aa  267  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0268324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  32.8 
 
 		 501 aa  266  5e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>