More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1213 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 228 aa  458  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  78.76 
 
 		 229 aa  367  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  73.78 
 
 		 225 aa  340  1e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  37.62 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1944  TrkA domain-containing protein  36.68 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.772638 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0505  TrkA domain-containing protein  38.31 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  28.05 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  28.05 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  33.82 
 
 		 220 aa  108  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  27.35 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  27.93 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  27.48 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  27.75 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  27.03 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  28.24 
 
 		 443 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  29.57 
 
 		 450 aa  102  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  32.27 
 
 		 450 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4120  TrkA-N domain protein  34.85 
 
 		 132 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  30.41 
 
 		 445 aa  95.5  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  28.91 
 
 		 458 aa  94  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  29.78 
 
 		 610 aa  94  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  27.96 
 
 		 458 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  28.44 
 
 		 458 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  28.91 
 
 		 458 aa  93.2  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  29.47 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  34.12 
 
 		 445 aa  92.4  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  25.73 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  27.98 
 
 		 457 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2476  potassium transporter peripheral membrane component  27.96 
 
 		 458 aa  91.7  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  29.73 
 
 		 221 aa  91.7  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  32.23 
 
 		 444 aa  91.3  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  27.06 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  30 
 
 		 458 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  27.52 
 
 		 457 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  27.49 
 
 		 458 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  27.49 
 
 		 458 aa  90.5  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  27.49 
 
 		 458 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0905  TrkA-N domain protein  26.03 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  27.4 
 
 		 458 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  30.81 
 
 		 444 aa  89.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  26.61 
 
 		 457 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  26.61 
 
 		 457 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  27.73 
 
 		 444 aa  89  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  26.27 
 
 		 457 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  28.1 
 
 		 458 aa  88.6  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  26.27 
 
 		 457 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  31.22 
 
 		 231 aa  88.6  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  29.28 
 
 		 223 aa  88.6  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  27.49 
 
 		 458 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  27.49 
 
 		 458 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  27.49 
 
 		 458 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  27.52 
 
 		 458 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  27.49 
 
 		 458 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1453  potassium transporter peripheral membrane component  27.52 
 
 		 458 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687964  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  27.49 
 
 		 458 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  34.01 
 
 		 153 aa  87  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  24.46 
 
 		 449 aa  87  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1454  TrkA-N domain protein  33.02 
 
 		 443 aa  87  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  27.52 
 
 		 458 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  25.99 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  32.88 
 
 		 458 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  26.54 
 
 		 458 aa  86.3  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  27.01 
 
 		 458 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  27.01 
 
 		 458 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  27.01 
 
 		 458 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  27.01 
 
 		 458 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  27.01 
 
 		 458 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  27.01 
 
 		 458 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  27.01 
 
 		 458 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3673  TrkA-N domain protein  30.92 
 
 		 444 aa  85.9  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728396  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  27.01 
 
 		 458 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  27.01 
 
 		 458 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  27.6 
 
 		 449 aa  85.5  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  25.23 
 
 		 218 aa  85.5  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  28.1 
 
 		 458 aa  85.5  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  31.28 
 
 		 445 aa  85.5  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  31.14 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  31.13 
 
 		 630 aa  84.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2242  potassium transporter peripheral membrane component  28.57 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0521644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0032  potassium transporter peripheral membrane component  25.68 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0670474 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1569  potassium transporter peripheral membrane component  27.52 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0202479  normal  0.0449671 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  33.02 
 
 		 628 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1400  TrkA-N domain-containing protein  23.74 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  26.07 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  27.01 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  25.23 
 
 		 457 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3183  potassium transporter peripheral membrane component  25.35 
 
 		 465 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00657284  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  28.57 
 
 		 457 aa  82  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  29.73 
 
 		 458 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  30.22 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1265  hypothetical protein  25.74 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  32.46 
 
 		 617 aa  81.6  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  23.42 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  30.14 
 
 		 371 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  27.62 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  30.22 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  24.32 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  29.52 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  25.34 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>