155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_05500 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_05500  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 409 aa  837    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.97959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2480  hypothetical protein  37.07 
 
 		 407 aa  286  7e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.400243  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2663  hypothetical protein  37.07 
 
 		 407 aa  286  7e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2442  MerR family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000095607  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2411  MerR family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 434 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2728  hypothetical protein  36.59 
 
 		 407 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.066619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2678  hypothetical protein  36.59 
 
 		 434 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000191981 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2685  hypothetical protein  38.29 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2626  hypothetical protein  37.8 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.413901  decreased coverage  0.000000430774 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2698  hypothetical protein  35.85 
 
 		 434 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0139158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3178  MerR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000968255  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 148 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00394  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  29.7 
 
 		 144 aa  55.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  31.82 
 
 		 133 aa  55.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 148 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000376  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  35.94 
 
 		 128 aa  53.9  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2996  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 152 aa  53.9  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2120  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 147 aa  53.9  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00663209  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 122 aa  53.9  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  23.48 
 
 		 158 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  23.48 
 
 		 158 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  26 
 
 		 156 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02411  Transcriptional regulator, MerR family protein  25.83 
 
 		 151 aa  51.6  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1604  MerR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 132 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408044  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2617  transcriptional regulator MerR family  28.44 
 
 		 130 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874214  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  30.84 
 
 		 253 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1094  MerR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 159 aa  50.4  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 267 aa  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3819  MerR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 153 aa  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0221891 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2969  MerR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 130 aa  50.1  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0979935  normal  0.0797223 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001544  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  32.81 
 
 		 124 aa  49.7  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 128 aa  49.7  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0464  transcriptional regulator, MerR family  23.48 
 
 		 134 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4252  MerR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 134 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.285942  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0466  MerR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 120 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2322  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 129 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2200  MerR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 132 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515575  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2244  regulatory protein, MerR  28.57 
 
 		 135 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 144 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  33.82 
 
 		 148 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0875  MerR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 131 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.854449 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2292  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 131 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1720  MerR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 134 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05481  hypothetical protein  32.81 
 
 		 127 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  25.42 
 
 		 146 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0266  transcriptional regulator, MerR family  34.92 
 
 		 161 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988584 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0133  MerR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 151 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 141 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 144 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1556  MerR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 133 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.659749  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1363  MerR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 134 aa  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0004  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1179  transcriptional regulator, putative  26.61 
 
 		 128 aa  47.4  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0654796  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  28.36 
 
 		 250 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1138  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 		 128 aa  47.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0775517  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4201  MerR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 149 aa  47.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952252 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  27.45 
 
 		 154 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3152  MerR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 131 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.335124  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1898  transcriptional regulator, putative  26.79 
 
 		 134 aa  47  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1531  transcriptional regulator, MerR family  26.79 
 
 		 135 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0114  transcriptional regulator, MerR family  28.45 
 
 		 329 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000486675  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1538  MerR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 153 aa  47  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0024  MerR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 156 aa  47  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1259  MerR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 128 aa  47  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2827  MerR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 135 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2845  MerR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 135 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2012  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 129 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.474573  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2796  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 132 aa  47  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0181  MerR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 144 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 150 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2972  MerR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 135 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.54764  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  30.63 
 
 		 142 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 237 aa  46.6  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2321  MerR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 134 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2393  MerR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 134 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1673  MerR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 134 aa  47  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  24.24 
 
 		 302 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1311  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 330 aa  47  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.0692282 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1511  regulatory protein, MerR  27.68 
 
 		 178 aa  46.6  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2726  transcriptional regulator, MerR family protein  33.33 
 
 		 136 aa  46.6  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505695  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 186 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2068  transcriptional regulator, MerR family  28.44 
 
 		 128 aa  46.6  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1865  transcriptional regulator, MerR family  28.44 
 
 		 128 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.0420495 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0702  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 119 aa  45.8  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.271355  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1034  MerR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 128 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0151455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  27.1 
 
 		 155 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  30.91 
 
 		 132 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2220  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 314 aa  46.2  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4442  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 145 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  30.84 
 
 		 124 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  30.69 
 
 		 139 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 253 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3099  MerR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 143 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00609185  decreased coverage  0.00847969 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 166 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  31 
 
 		 139 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 147 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 166 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1416  MerR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 175 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.185788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2569  MerR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 133 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1354  regulatory protein, MerR  27.27 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>