129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_2663 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2698  hypothetical protein  85.01 
 
 
434 aa  701    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0139158  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2480  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  818    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.400243  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2442  MerR family transcriptional regulator  98.77 
 
 
434 aa  808    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000095607  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2411  MerR family transcriptional regulator  98.28 
 
 
434 aa  803    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2663  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  818    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2678  hypothetical protein  99.02 
 
 
434 aa  810    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000191981 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2728  hypothetical protein  96.81 
 
 
407 aa  795    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.066619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2685  hypothetical protein  73.71 
 
 
407 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2626  hypothetical protein  73.71 
 
 
407 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.413901  decreased coverage  0.000000430774 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05500  putative transcriptional regulator, MerR family  37.07 
 
 
409 aa  286  5.999999999999999e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.97959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3178  MerR family transcriptional regulator  23.87 
 
 
410 aa  126  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000968255  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  31.53 
 
 
133 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000376  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  34.51 
 
 
128 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1968  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.42 
 
 
698 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4950  regulatory protein, MerR  28.44 
 
 
146 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0034872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
155 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  38.81 
 
 
136 aa  51.2  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  40.62 
 
 
154 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001544  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  42.19 
 
 
124 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2256  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
136 aa  51.2  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
139 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0529  Methyltransferase type 11  34 
 
 
268 aa  50.4  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.636084 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
132 aa  50.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
142 aa  50.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
142 aa  50.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  27.89 
 
 
152 aa  50.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1816  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  23.87 
 
 
277 aa  50.1  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05481  hypothetical protein  42.19 
 
 
127 aa  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
289 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
137 aa  49.7  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  26.96 
 
 
142 aa  49.7  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2851  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 
135 aa  49.7  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0170  transcriptional regulator, MerR family  37.29 
 
 
232 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.491703  normal  0.95785 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3819  MerR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
153 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0221891 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  29.73 
 
 
138 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  30.17 
 
 
129 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2996  transcriptional regulator, MerR family  30.48 
 
 
152 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
146 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
156 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4442  MerR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
145 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00354  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  31.34 
 
 
136 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.784451  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
137 aa  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
149 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
141 aa  47.8  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  25.49 
 
 
148 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
161 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  30.17 
 
 
129 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  25.49 
 
 
148 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  31.34 
 
 
141 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1094  MerR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
159 aa  47.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  32.81 
 
 
141 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2866  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
138 aa  46.6  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  27.19 
 
 
142 aa  46.6  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1778  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  24.84 
 
 
283 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1791  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
151 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0701164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
129 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0323  transcriptional regulator  34.51 
 
 
117 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0420386  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0461  MerR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
174 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0313707  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  29.73 
 
 
132 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
126 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5384  transcriptional regulator, MerR family  27.43 
 
 
149 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  37.31 
 
 
133 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
125 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  24.77 
 
 
143 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
125 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2120  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
147 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00663209  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
166 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
125 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
270 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
186 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 
134 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 
134 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 
134 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 
134 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2987  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
290 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0714  putative transcriptional regulator, MerR family  27.52 
 
 
142 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1511  regulatory protein, MerR  28.81 
 
 
178 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2200  MerR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
132 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515575  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
139 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
129 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 
135 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0875  MerR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
131 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.854449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1354  regulatory protein, MerR  30.3 
 
 
333 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1311  MerR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
330 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.0692282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
157 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1604  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
132 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408044  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0024  MerR family transcriptional regulator  26.96 
 
 
156 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0245  transcriptional regulator  31.31 
 
 
123 aa  44.3  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
133 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
163 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  21.08 
 
 
274 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  26.72 
 
 
154 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 
169 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
129 aa  43.9  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  21.36 
 
 
259 aa  43.9  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
129 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2292  MerR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
131 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0840  transcriptional regulator  29.29 
 
 
133 aa  43.9  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.413569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3099  MerR family transcriptional regulator  23.68 
 
 
143 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00609185  decreased coverage  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00394  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  33.33 
 
 
144 aa  43.9  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>