112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_2442 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2698  hypothetical protein  83.87 
 
 
434 aa  740    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0139158  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2480  hypothetical protein  98.77 
 
 
407 aa  808    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.400243  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2442  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
434 aa  869    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000095607  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2411  MerR family transcriptional regulator  97 
 
 
434 aa  818    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2663  hypothetical protein  98.77 
 
 
407 aa  808    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2728  hypothetical protein  97.05 
 
 
407 aa  797    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.066619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2678  hypothetical protein  97.7 
 
 
434 aa  827    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000191981 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2685  hypothetical protein  73.46 
 
 
407 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2626  hypothetical protein  73.46 
 
 
407 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.413901  decreased coverage  0.000000430774 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05500  putative transcriptional regulator, MerR family  36.83 
 
 
409 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.97959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3178  MerR family transcriptional regulator  24.21 
 
 
410 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000968255  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  39.44 
 
 
136 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4950  regulatory protein, MerR  28.44 
 
 
146 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0034872 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000376  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  42.19 
 
 
128 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2256  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
136 aa  52.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
155 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
289 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001544  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  42.19 
 
 
124 aa  51.2  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1968  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.06 
 
 
698 aa  50.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  38.46 
 
 
154 aa  50.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2851  transcriptional regulator, MerR family  28.81 
 
 
135 aa  50.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  23.39 
 
 
148 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  23.39 
 
 
148 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0529  Methyltransferase type 11  34 
 
 
268 aa  50.4  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.636084 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1816  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  23.87 
 
 
277 aa  50.4  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05481  hypothetical protein  41.79 
 
 
127 aa  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3819  MerR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
153 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0221891 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  30.09 
 
 
133 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00354  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  25.42 
 
 
136 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.784451  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2996  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
152 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
149 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  23.2 
 
 
171 aa  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
161 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4442  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
145 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
132 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1511  regulatory protein, MerR  27.64 
 
 
178 aa  47.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0170  transcriptional regulator, MerR family  35.59 
 
 
232 aa  47.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.491703  normal  0.95785 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2200  MerR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
132 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515575  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
139 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0875  MerR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
131 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.854449 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  29.31 
 
 
129 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
156 aa  47  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
165 aa  47  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  29.52 
 
 
152 aa  46.6  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
142 aa  47  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0461  MerR family transcriptional regulator  24.58 
 
 
174 aa  46.6  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0313707  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1778  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, putative  24.84 
 
 
283 aa  45.8  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1791  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
151 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0701164 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5384  transcriptional regulator, MerR family  29.09 
 
 
149 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0323  transcriptional regulator  33.63 
 
 
117 aa  46.2  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0420386  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2292  MerR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
131 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
270 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
186 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1094  MerR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
159 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  26.72 
 
 
154 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  26.96 
 
 
145 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  29.31 
 
 
129 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 
293 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  24.32 
 
 
141 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0024  MerR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
156 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
146 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2866  MerR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
138 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2120  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
147 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00663209  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4984  MerR family transcriptional regulator  22.81 
 
 
145 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
142 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
142 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
157 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  26.72 
 
 
154 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  26.72 
 
 
154 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  26.72 
 
 
154 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  26.72 
 
 
154 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
147 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0245  transcriptional regulator  33.7 
 
 
123 aa  44.7  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2987  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
290 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  28.32 
 
 
132 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
126 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  35.62 
 
 
135 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1604  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
132 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408044  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  30.88 
 
 
141 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  26.79 
 
 
273 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  35.82 
 
 
133 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
129 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
166 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
134 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
134 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
134 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
134 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 
256 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  28.7 
 
 
138 aa  44.3  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
149 aa  43.9  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
137 aa  43.5  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0702  transcriptional regulator  32.98 
 
 
119 aa  43.5  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.271355  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0386  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
144 aa  43.5  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.675924  normal  0.0916275 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
139 aa  43.5  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1538  MerR family transcriptional regulator  23.73 
 
 
153 aa  43.5  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129222  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2726  transcriptional regulator, MerR family protein  28.85 
 
 
136 aa  43.5  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505695  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0738  methyltransferase type 11  25.2 
 
 
236 aa  43.5  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  20.39 
 
 
259 aa  43.5  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  23.89 
 
 
148 aa  43.5  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  32.35 
 
 
171 aa  43.1  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>