105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5508 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5508  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  100 
 
 
104 aa  214  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  35.29 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.96 
 
 
99 aa  57  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  29.59 
 
 
242 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2251  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.66 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.322428  normal  0.209318 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  30.39 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.79 
 
 
102 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.680425  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.78 
 
 
101 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535859  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1482  Rieske (2Fe-2S) region  35.42 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.67 
 
 
114 aa  52  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2847  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.37 
 
 
120 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.15292  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  28.89 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.69 
 
 
100 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3238  Rieske 2Fe-2S family protein  33.33 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.69 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000504578 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4634  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.98 
 
 
111 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3558  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.98 
 
 
111 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2894  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.27 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  34.62 
 
 
119 aa  50.1  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3232  Rieske (2Fe-2S) region  34.74 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.74 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4109  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  34.88 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  28.43 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18750  phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  39.73 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485806  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3495  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.69 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.65589  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42200  Rieske type ferredoxin  34.34 
 
 
122 aa  47.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.42204  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3081  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33 
 
 
114 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0978825  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0893  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.04 
 
 
106 aa  47  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203676  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14640  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  36.99 
 
 
112 aa  47  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.857724  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0586  Rieske 2Fe-2S family protein  32.04 
 
 
104 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6339  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.41 
 
 
125 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.515952 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.15 
 
 
110 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.543189 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0994  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.73 
 
 
110 aa  47  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.25 
 
 
100 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  30.3 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1004  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  25.25 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.749918 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0162  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
98 aa  45.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.25 
 
 
102 aa  45.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.359094 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.3 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1586  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.39 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0271  putative dioxygenase ferredoxin subunit  31.43 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.85 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3342  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.62 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139334  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3775  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.06 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0780  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.39 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.12357  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  34.72 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3194  Rieske (2Fe-2S) region  32 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.5117e-17  hitchhiker  4.2038099999999998e-22 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4027  hypothetical protein  28.87 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01974  benzene 1,2-dioxygenase ferredoxin protein  36.99 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0274053  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1989  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  24.49 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  29.9 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2423  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  26.53 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2471  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  26.53 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2265  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.53 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  26.03 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2070  MocE Rieske (2Fe-2S)  29.81 
 
 
102 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143591  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2681  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.81 
 
 
102 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.03 
 
 
96 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3866  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.53 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0992  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  hitchhiker  0.00000000116756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.12 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0965  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.92 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00646524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2710  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.81 
 
 
102 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.332301  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2768  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2226  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1359  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.74 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0434  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.74 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2734  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.77 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.44 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1935  hypothetical protein  28.18 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455363  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.51 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.43 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0930  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.73 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1673  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  35.82 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314946  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1861  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.81 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1282  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.17 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.580287  normal  0.705623 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6009  Rieske (2Fe-2S) protein  29.81 
 
 
102 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322393  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3687  Rieske (2Fe-2S) region  27.1 
 
 
129 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  30.77 
 
 
102 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2105  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.99 
 
 
118 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3760  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.1 
 
 
129 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.44 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3700  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.1 
 
 
129 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
111 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2815  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.21 
 
 
107 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.717991 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0455  Rieske (2Fe-2S) region  32.84 
 
 
108 aa  41.2  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.88 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0797  nitrite reductase small subunit  25 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  32.35 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  32.98 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1662  Rieske (2Fe-2S) protein  34.72 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7184  Rieske (2Fe-2S) domain protein, MocE subfamily  26 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00608599  normal  0.029061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3198  ferredoxin, 2Fe-2S  31.33 
 
 
112 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0027175  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.08 
 
 
110 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2961  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  35.14 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1143  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  33.33 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0991  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.13 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.220686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>