47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0516 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 		 110 aa  219  7e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.543189 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0539  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.4 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.32078  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0530  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  59.42 
 
 		 90 aa  83.6  9e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.610138  normal  0.577368 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0522  hypothetical protein  43.21 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1468  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.64 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.91 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.705451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2226  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.71 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000457155  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1263  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.12 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.227252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1004  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.43 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.749918 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0780  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.12357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5508  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.15 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.37 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2135  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.56 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.15 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2796  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  25.44 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.51 
 
 		 294 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1987  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.75 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.47 
 
 		 521 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2561  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  29.52 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2705  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  29.52 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0205  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.52 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1577  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  29.52 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869936  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1380  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  29.52 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0513  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  28.7 
 
 		 303 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0981  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.52 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0236  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  29.52 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2675  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.86 
 
 		 506 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1119  anthranilate dioxygenase ferredoxin subunit(AndAb)  30.48 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.8 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1258  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.18 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0240354  hitchhiker  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5152  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.18 
 
 		 108 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1349  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.38 
 
 		 95 aa  42  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.203828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30 
 
 		 293 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3775  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.78 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5941  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.14 
 
 		 526 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01479  dioxygenase, ferredoxin reductase component, putative  34.82 
 
 		 559 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3441  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.93 
 
 		 599 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03310  conserved hypothetical protein  34.65 
 
 		 585 aa  40.8  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2541  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.03 
 
 		 506 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03296  conserved hypothetical protein  33.71 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0596852 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  32.69 
 
 		 238 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0333  Rieske (2Fe-2S) protein  28.57 
 
 		 298 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2677  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  33.93 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0490  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.57 
 
 		 109 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2251  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 		 104 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.322428  normal  0.209318 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.26 
 
 		 504 aa  40  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  24.21 
 
 		 163 aa  40  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>