64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0539 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0539  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
123 aa  253  6e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.32078  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0522  hypothetical protein  56.32 
 
 
92 aa  117  7e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.393571 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.4 
 
 
110 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.543189 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.37 
 
 
101 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.705451 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4149  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.13 
 
 
109 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411915  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1468  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.07 
 
 
101 aa  52.8  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1335  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000656447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1307  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
116 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1263  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.44 
 
 
113 aa  50.1  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.227252  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2226  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.48 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000457155  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0530  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.610138  normal  0.577368 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  37.37 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1194  biphenyl 2,3-dioxygenase ferredoxin subunit (BphA3)  30.19 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0889683  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0205  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  26.8 
 
 
109 aa  48.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0236  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  26.8 
 
 
109 aa  48.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2561  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  26.8 
 
 
109 aa  48.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2705  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  26.8 
 
 
109 aa  48.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0981  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  26.8 
 
 
109 aa  48.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1380  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  26.8 
 
 
109 aa  48.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1577  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, ferredoxin subunit  26.8 
 
 
109 aa  48.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869936  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0490  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.74 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4955  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.43 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519732  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3669  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.43 
 
 
108 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.738821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5504  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.43 
 
 
108 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.124598  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3746  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.43 
 
 
108 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108566  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3777  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.43 
 
 
108 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.872692  normal  0.412492 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  32 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4586  Rieske (2Fe-2S) region  28.43 
 
 
108 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312616  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.37 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112377 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02396  hypothetical protein  28.7 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2692  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  28.7 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3772  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  28.7 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2825  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  28.7 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1137  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  28.7 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2693  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  28.7 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.77141  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02432  3-phenylpropionate dioxygenase, predicted ferredoxin subunit  28.7 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1128  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.7 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2323  Rieske (2Fe-2S) protein  28.43 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2249  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  24.56 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.19 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.93 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3443  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.57 
 
 
116 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775174 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0780  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.97 
 
 
100 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.12357  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1119  anthranilate dioxygenase ferredoxin subunit(AndAb)  26.8 
 
 
107 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.76 
 
 
109 aa  41.2  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724379  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28 
 
 
374 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000071782  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1110  anthranilate dioxygenase ferredoxin reductase(AndAb)  22.12 
 
 
107 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662253  normal  0.22099 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0562  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.49 
 
 
106 aa  41.2  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1970  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.63 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2057  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  25.74 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.69 
 
 
106 aa  40.8  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149896  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1989  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  30.61 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
294 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4522  Rieske (2Fe-2S) region  32.08 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2671  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.24 
 
 
104 aa  40.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.506336  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3700  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.2 
 
 
129 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3760  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.2 
 
 
129 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3687  Rieske (2Fe-2S) region  29.2 
 
 
129 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2471  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  32.35 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2423  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  32.35 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1004  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  28.04 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.749918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.2 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.349012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>